Protein–RNA interactions for Protein: Q52KH6

Gm14685, DNA segment, Chr X, Baylor 18, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm14685Q52KH6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm14685Q52KH6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm14685Q52KH6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm14685Q52KH6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm14685Q52KH6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm14685Q52KH6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm14685Q52KH6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm14685Q52KH6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm14685Q52KH6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm14685Q52KH6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm14685Q52KH6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm14685Q52KH6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm14685Q52KH6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm14685Q52KH6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm14685Q52KH6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm14685Q52KH6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm14685Q52KH6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm14685Q52KH6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm14685Q52KH6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm14685Q52KH6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm14685Q52KH6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm14685Q52KH6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm14685Q52KH6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm14685Q52KH6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm14685Q52KH6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm14685Q52KH6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm14685Q52KH6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm14685Q52KH6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gm14685Q52KH6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm14685Q52KH6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm14685Q52KH6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm14685Q52KH6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm14685Q52KH6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm14685Q52KH6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm14685Q52KH6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm14685Q52KH6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm14685Q52KH6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm14685Q52KH6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm14685Q52KH6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm14685Q52KH6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm14685Q52KH6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm14685Q52KH6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm14685Q52KH6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm14685Q52KH6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm14685Q52KH6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm14685Q52KH6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm14685Q52KH6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm14685Q52KH6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm14685Q52KH6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm14685Q52KH6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm14685Q52KH6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm14685Q52KH6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm14685Q52KH6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm14685Q52KH6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm14685Q52KH6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm14685Q52KH6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm14685Q52KH6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm14685Q52KH6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm14685Q52KH6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm14685Q52KH6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm14685Q52KH6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm14685Q52KH6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm14685Q52KH6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm14685Q52KH6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm14685Q52KH6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm14685Q52KH6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm14685Q52KH6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm14685Q52KH6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm14685Q52KH6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gm14685Q52KH6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm14685Q52KH6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm14685Q52KH6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm14685Q52KH6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm14685Q52KH6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm14685Q52KH6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm14685Q52KH6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm14685Q52KH6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm14685Q52KH6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm14685Q52KH6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm14685Q52KH6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm14685Q52KH6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm14685Q52KH6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm14685Q52KH6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm14685Q52KH6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm14685Q52KH6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm14685Q52KH6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm14685Q52KH6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm14685Q52KH6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm14685Q52KH6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm14685Q52KH6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm14685Q52KH6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm14685Q52KH6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm14685Q52KH6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm14685Q52KH6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm14685Q52KH6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm14685Q52KH6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm14685Q52KH6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm14685Q52KH6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm14685Q52KH6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm14685Q52KH6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms