Protein–RNA interactions for Protein: Q499E6

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q499E6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf109Q499E6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1orf109Q499E6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1orf109Q499E6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1orf109Q499E6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1orf109Q499E6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
C1orf109Q499E6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1orf109Q499E6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf109Q499E6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf109Q499E6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf109Q499E6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf109Q499E6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf109Q499E6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf109Q499E6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C1orf109Q499E6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
C1orf109Q499E6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
C1orf109Q499E6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C1orf109Q499E6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C1orf109Q499E6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C1orf109Q499E6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C1orf109Q499E6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf109Q499E6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf109Q499E6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf109Q499E6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf109Q499E6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf109Q499E6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf109Q499E6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf109Q499E6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf109Q499E6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf109Q499E6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf109Q499E6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf109Q499E6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf109Q499E6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf109Q499E6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf109Q499E6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf109Q499E6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf109Q499E6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf109Q499E6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf109Q499E6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf109Q499E6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf109Q499E6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1orf109Q499E6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1orf109Q499E6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1orf109Q499E6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
C1orf109Q499E6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C1orf109Q499E6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C1orf109Q499E6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf109Q499E6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf109Q499E6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf109Q499E6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf109Q499E6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf109Q499E6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf109Q499E6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf109Q499E6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf109Q499E6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf109Q499E6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf109Q499E6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf109Q499E6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf109Q499E6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf109Q499E6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf109Q499E6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf109Q499E6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf109Q499E6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf109Q499E6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf109Q499E6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf109Q499E6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf109Q499E6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf109Q499E6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf109Q499E6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf109Q499E6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf109Q499E6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf109Q499E6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf109Q499E6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf109Q499E6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf109Q499E6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf109Q499E6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf109Q499E6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf109Q499E6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf109Q499E6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf109Q499E6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf109Q499E6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf109Q499E6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf109Q499E6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf109Q499E6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf109Q499E6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf109Q499E6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf109Q499E6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf109Q499E6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf109Q499E6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf109Q499E6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf109Q499E6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf109Q499E6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf109Q499E6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf109Q499E6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf109Q499E6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf109Q499E6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf109Q499E6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf109Q499E6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf109Q499E6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf109Q499E6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms