Protein–RNA interactions for Protein: Q499D5

Zfp235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp235Q499D5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp235Q499D5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp235Q499D5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp235Q499D5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp235Q499D5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp235Q499D5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp235Q499D5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp235Q499D5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp235Q499D5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp235Q499D5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp235Q499D5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp235Q499D5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp235Q499D5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp235Q499D5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp235Q499D5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp235Q499D5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp235Q499D5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp235Q499D5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp235Q499D5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp235Q499D5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp235Q499D5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp235Q499D5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp235Q499D5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp235Q499D5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp235Q499D5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp235Q499D5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp235Q499D5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp235Q499D5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp235Q499D5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp235Q499D5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp235Q499D5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp235Q499D5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp235Q499D5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp235Q499D5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp235Q499D5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp235Q499D5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp235Q499D5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp235Q499D5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zfp235Q499D5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp235Q499D5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp235Q499D5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp235Q499D5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp235Q499D5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp235Q499D5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp235Q499D5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp235Q499D5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp235Q499D5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp235Q499D5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp235Q499D5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp235Q499D5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp235Q499D5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp235Q499D5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp235Q499D5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp235Q499D5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp235Q499D5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp235Q499D5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp235Q499D5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp235Q499D5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp235Q499D5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp235Q499D5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp235Q499D5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp235Q499D5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp235Q499D5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp235Q499D5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp235Q499D5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp235Q499D5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp235Q499D5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp235Q499D5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp235Q499D5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp235Q499D5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp235Q499D5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp235Q499D5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp235Q499D5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp235Q499D5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp235Q499D5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp235Q499D5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp235Q499D5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp235Q499D5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp235Q499D5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp235Q499D5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp235Q499D5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp235Q499D5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp235Q499D5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp235Q499D5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp235Q499D5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp235Q499D5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp235Q499D5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp235Q499D5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp235Q499D5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp235Q499D5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp235Q499D5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp235Q499D5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp235Q499D5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp235Q499D5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp235Q499D5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp235Q499D5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp235Q499D5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp235Q499D5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp235Q499D5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp235Q499D5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms