Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Fam228bQ497Q6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fam228bQ497Q6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fam228bQ497Q6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fam228bQ497Q6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fam228bQ497Q6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Fam228bQ497Q6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fam228bQ497Q6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fam228bQ497Q6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fam228bQ497Q6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fam228bQ497Q6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fam228bQ497Q6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Fam228bQ497Q6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fam228bQ497Q6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Fam228bQ497Q6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Fam228bQ497Q6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fam228bQ497Q6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fam228bQ497Q6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fam228bQ497Q6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fam228bQ497Q6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fam228bQ497Q6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fam228bQ497Q6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fam228bQ497Q6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fam228bQ497Q6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fam228bQ497Q6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fam228bQ497Q6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fam228bQ497Q6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fam228bQ497Q6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Fam228bQ497Q6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fam228bQ497Q6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fam228bQ497Q6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fam228bQ497Q6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fam228bQ497Q6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fam228bQ497Q6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fam228bQ497Q6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fam228bQ497Q6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fam228bQ497Q6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fam228bQ497Q6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fam228bQ497Q6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fam228bQ497Q6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fam228bQ497Q6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fam228bQ497Q6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fam228bQ497Q6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fam228bQ497Q6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Fam228bQ497Q6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fam228bQ497Q6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fam228bQ497Q6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fam228bQ497Q6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Fam228bQ497Q6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fam228bQ497Q6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fam228bQ497Q6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fam228bQ497Q6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fam228bQ497Q6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fam228bQ497Q6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fam228bQ497Q6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fam228bQ497Q6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fam228bQ497Q6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Fam228bQ497Q6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fam228bQ497Q6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fam228bQ497Q6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fam228bQ497Q6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Fam228bQ497Q6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Fam228bQ497Q6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Fam228bQ497Q6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Fam228bQ497Q6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Fam228bQ497Q6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Fam228bQ497Q6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fam228bQ497Q6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fam228bQ497Q6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Fam228bQ497Q6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fam228bQ497Q6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fam228bQ497Q6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fam228bQ497Q6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fam228bQ497Q6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fam228bQ497Q6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fam228bQ497Q6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Fam228bQ497Q6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fam228bQ497Q6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fam228bQ497Q6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fam228bQ497Q6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fam228bQ497Q6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fam228bQ497Q6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Fam228bQ497Q6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fam228bQ497Q6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fam228bQ497Q6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fam228bQ497Q6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fam228bQ497Q6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fam228bQ497Q6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fam228bQ497Q6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fam228bQ497Q6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fam228bQ497Q6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fam228bQ497Q6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Fam228bQ497Q6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fam228bQ497Q6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fam228bQ497Q6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fam228bQ497Q6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fam228bQ497Q6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fam228bQ497Q6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Fam228bQ497Q6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Fam228bQ497Q6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms