Protein–RNA interactions for Protein: Q3V384

Afg1l, AFG1-like ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg1lQ3V384 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Afg1lQ3V384 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Afg1lQ3V384 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Afg1lQ3V384 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Afg1lQ3V384 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Afg1lQ3V384 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Afg1lQ3V384 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Afg1lQ3V384 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Afg1lQ3V384 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Afg1lQ3V384 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Afg1lQ3V384 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Afg1lQ3V384 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Afg1lQ3V384 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Afg1lQ3V384 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Afg1lQ3V384 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Afg1lQ3V384 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Afg1lQ3V384 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Afg1lQ3V384 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Afg1lQ3V384 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Afg1lQ3V384 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Afg1lQ3V384 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Afg1lQ3V384 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Afg1lQ3V384 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Afg1lQ3V384 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Afg1lQ3V384 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Afg1lQ3V384 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Afg1lQ3V384 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Afg1lQ3V384 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Afg1lQ3V384 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Afg1lQ3V384 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Afg1lQ3V384 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Afg1lQ3V384 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Afg1lQ3V384 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Afg1lQ3V384 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Afg1lQ3V384 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Afg1lQ3V384 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Afg1lQ3V384 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Afg1lQ3V384 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Afg1lQ3V384 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Afg1lQ3V384 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Afg1lQ3V384 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Afg1lQ3V384 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Afg1lQ3V384 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Afg1lQ3V384 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Afg1lQ3V384 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Afg1lQ3V384 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Afg1lQ3V384 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Afg1lQ3V384 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Afg1lQ3V384 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Afg1lQ3V384 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Afg1lQ3V384 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Afg1lQ3V384 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Afg1lQ3V384 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Afg1lQ3V384 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Afg1lQ3V384 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Afg1lQ3V384 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Afg1lQ3V384 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Afg1lQ3V384 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Afg1lQ3V384 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Afg1lQ3V384 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Afg1lQ3V384 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Afg1lQ3V384 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Afg1lQ3V384 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Afg1lQ3V384 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Afg1lQ3V384 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Afg1lQ3V384 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Afg1lQ3V384 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Afg1lQ3V384 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Afg1lQ3V384 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Afg1lQ3V384 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Afg1lQ3V384 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Afg1lQ3V384 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Afg1lQ3V384 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Afg1lQ3V384 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Afg1lQ3V384 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Afg1lQ3V384 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Afg1lQ3V384 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Afg1lQ3V384 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Afg1lQ3V384 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Afg1lQ3V384 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Afg1lQ3V384 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Afg1lQ3V384 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Afg1lQ3V384 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Afg1lQ3V384 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Afg1lQ3V384 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Afg1lQ3V384 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Afg1lQ3V384 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Afg1lQ3V384 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Afg1lQ3V384 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Afg1lQ3V384 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Afg1lQ3V384 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Afg1lQ3V384 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Afg1lQ3V384 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Afg1lQ3V384 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Afg1lQ3V384 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Afg1lQ3V384 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Afg1lQ3V384 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Afg1lQ3V384 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Afg1lQ3V384 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Afg1lQ3V384 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms