Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Y1

Ppp4r3c, Protein PPP4R3C, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3cQ3V0Y1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppp4r3cQ3V0Y1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp4r3cQ3V0Y1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp4r3cQ3V0Y1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp4r3cQ3V0Y1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp4r3cQ3V0Y1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp4r3cQ3V0Y1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp4r3cQ3V0Y1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp4r3cQ3V0Y1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp4r3cQ3V0Y1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp4r3cQ3V0Y1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp4r3cQ3V0Y1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp4r3cQ3V0Y1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp4r3cQ3V0Y1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp4r3cQ3V0Y1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp4r3cQ3V0Y1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp4r3cQ3V0Y1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp4r3cQ3V0Y1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp4r3cQ3V0Y1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp4r3cQ3V0Y1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp4r3cQ3V0Y1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp4r3cQ3V0Y1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp4r3cQ3V0Y1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp4r3cQ3V0Y1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp4r3cQ3V0Y1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp4r3cQ3V0Y1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp4r3cQ3V0Y1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp4r3cQ3V0Y1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp4r3cQ3V0Y1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp4r3cQ3V0Y1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp4r3cQ3V0Y1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp4r3cQ3V0Y1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp4r3cQ3V0Y1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp4r3cQ3V0Y1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp4r3cQ3V0Y1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp4r3cQ3V0Y1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp4r3cQ3V0Y1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp4r3cQ3V0Y1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp4r3cQ3V0Y1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.2 ms