Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0U0

1700057G04Rik, Phospholipid scramblase, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700057G04RikQ3V0U0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,32■□□□□ 0,68
1700057G04RikQ3V0U0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,31■□□□□ 0,68
1700057G04RikQ3V0U0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,31■□□□□ 0,68
1700057G04RikQ3V0U0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19,31■□□□□ 0,68
1700057G04RikQ3V0U0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,31■□□□□ 0,68
1700057G04RikQ3V0U0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,31■□□□□ 0,68
1700057G04RikQ3V0U0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,3■□□□□ 0,68
1700057G04RikQ3V0U0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,3■□□□□ 0,68
1700057G04RikQ3V0U0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,3■□□□□ 0,68
1700057G04RikQ3V0U0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19,3■□□□□ 0,68
1700057G04RikQ3V0U0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19,3■□□□□ 0,68
1700057G04RikQ3V0U0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19,29■□□□□ 0,68
1700057G04RikQ3V0U0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19,29■□□□□ 0,68
1700057G04RikQ3V0U0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,29■□□□□ 0,68
1700057G04RikQ3V0U0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19,29■□□□□ 0,68
1700057G04RikQ3V0U0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19,29■□□□□ 0,68
1700057G04RikQ3V0U0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,29■□□□□ 0,68
1700057G04RikQ3V0U0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19,29■□□□□ 0,68
1700057G04RikQ3V0U0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19,29■□□□□ 0,68
1700057G04RikQ3V0U0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,28■□□□□ 0,68
1700057G04RikQ3V0U0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,28■□□□□ 0,68
1700057G04RikQ3V0U0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,28■□□□□ 0,68
1700057G04RikQ3V0U0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,28■□□□□ 0,68
1700057G04RikQ3V0U0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,28■□□□□ 0,68
1700057G04RikQ3V0U0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19,27■□□□□ 0,68
1700057G04RikQ3V0U0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19,27■□□□□ 0,68
1700057G04RikQ3V0U0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19,27■□□□□ 0,68
1700057G04RikQ3V0U0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,27■□□□□ 0,68
1700057G04RikQ3V0U0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19,26■□□□□ 0,67
1700057G04RikQ3V0U0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,26■□□□□ 0,67
1700057G04RikQ3V0U0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,26■□□□□ 0,67
1700057G04RikQ3V0U0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,26■□□□□ 0,67
1700057G04RikQ3V0U0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,25■□□□□ 0,67
1700057G04RikQ3V0U0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,25■□□□□ 0,67
1700057G04RikQ3V0U0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,24■□□□□ 0,67
1700057G04RikQ3V0U0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,24■□□□□ 0,67
1700057G04RikQ3V0U0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19,24■□□□□ 0,67
1700057G04RikQ3V0U0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,24■□□□□ 0,67
1700057G04RikQ3V0U0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,24■□□□□ 0,67
1700057G04RikQ3V0U0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19,24■□□□□ 0,67
1700057G04RikQ3V0U0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,23■□□□□ 0,67
1700057G04RikQ3V0U0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,23■□□□□ 0,67
1700057G04RikQ3V0U0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,23■□□□□ 0,67
1700057G04RikQ3V0U0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,23■□□□□ 0,67
1700057G04RikQ3V0U0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,23■□□□□ 0,67
1700057G04RikQ3V0U0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,22■□□□□ 0,67
1700057G04RikQ3V0U0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,22■□□□□ 0,67
1700057G04RikQ3V0U0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19,22■□□□□ 0,67
1700057G04RikQ3V0U0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19,21■□□□□ 0,67
1700057G04RikQ3V0U0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19,21■□□□□ 0,67
1700057G04RikQ3V0U0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,21■□□□□ 0,67
1700057G04RikQ3V0U0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19,2■□□□□ 0,66
1700057G04RikQ3V0U0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19,2■□□□□ 0,66
1700057G04RikQ3V0U0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,2■□□□□ 0,66
1700057G04RikQ3V0U0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,2■□□□□ 0,66
1700057G04RikQ3V0U0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,19■□□□□ 0,66
1700057G04RikQ3V0U0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19,19■□□□□ 0,66
1700057G04RikQ3V0U0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,19■□□□□ 0,66
1700057G04RikQ3V0U0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19,19■□□□□ 0,66
1700057G04RikQ3V0U0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,19■□□□□ 0,66
1700057G04RikQ3V0U0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19,19■□□□□ 0,66
1700057G04RikQ3V0U0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,18■□□□□ 0,66
1700057G04RikQ3V0U0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,18■□□□□ 0,66
1700057G04RikQ3V0U0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,17■□□□□ 0,66
1700057G04RikQ3V0U0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19,17■□□□□ 0,66
1700057G04RikQ3V0U0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,17■□□□□ 0,66
1700057G04RikQ3V0U0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19,16■□□□□ 0,66
1700057G04RikQ3V0U0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,16■□□□□ 0,66
1700057G04RikQ3V0U0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,16■□□□□ 0,66
1700057G04RikQ3V0U0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,16■□□□□ 0,66
1700057G04RikQ3V0U0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19,16■□□□□ 0,66
1700057G04RikQ3V0U0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,15■□□□□ 0,66
1700057G04RikQ3V0U0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19,15■□□□□ 0,66
1700057G04RikQ3V0U0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,15■□□□□ 0,66
1700057G04RikQ3V0U0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,15■□□□□ 0,66
1700057G04RikQ3V0U0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,15■□□□□ 0,66
1700057G04RikQ3V0U0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19,15■□□□□ 0,66
1700057G04RikQ3V0U0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,15■□□□□ 0,66
1700057G04RikQ3V0U0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,15■□□□□ 0,66
1700057G04RikQ3V0U0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,14■□□□□ 0,65
1700057G04RikQ3V0U0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19,14■□□□□ 0,65
1700057G04RikQ3V0U0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19,14■□□□□ 0,65
1700057G04RikQ3V0U0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,13■□□□□ 0,65
1700057G04RikQ3V0U0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19,13■□□□□ 0,65
1700057G04RikQ3V0U0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,13■□□□□ 0,65
1700057G04RikQ3V0U0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,13■□□□□ 0,65
1700057G04RikQ3V0U0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,13■□□□□ 0,65
1700057G04RikQ3V0U0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,12■□□□□ 0,65
1700057G04RikQ3V0U0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,12■□□□□ 0,65
1700057G04RikQ3V0U0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,12■□□□□ 0,65
1700057G04RikQ3V0U0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,11■□□□□ 0,65
1700057G04RikQ3V0U0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19,1■□□□□ 0,65
1700057G04RikQ3V0U0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19,1■□□□□ 0,65
1700057G04RikQ3V0U0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19,1■□□□□ 0,65
1700057G04RikQ3V0U0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,1■□□□□ 0,65
1700057G04RikQ3V0U0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19,09■□□□□ 0,65
1700057G04RikQ3V0U0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,09■□□□□ 0,65
1700057G04RikQ3V0U0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,09■□□□□ 0,65
1700057G04RikQ3V0U0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,09■□□□□ 0,65
1700057G04RikQ3V0U0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,09■□□□□ 0,65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms