Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWA4

Trim40, Tripartite motif-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim40Q3UWA4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim40Q3UWA4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim40Q3UWA4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim40Q3UWA4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim40Q3UWA4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim40Q3UWA4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim40Q3UWA4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim40Q3UWA4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim40Q3UWA4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim40Q3UWA4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim40Q3UWA4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim40Q3UWA4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim40Q3UWA4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim40Q3UWA4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim40Q3UWA4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim40Q3UWA4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim40Q3UWA4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim40Q3UWA4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim40Q3UWA4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim40Q3UWA4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim40Q3UWA4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim40Q3UWA4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim40Q3UWA4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim40Q3UWA4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim40Q3UWA4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim40Q3UWA4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim40Q3UWA4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim40Q3UWA4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim40Q3UWA4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim40Q3UWA4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim40Q3UWA4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim40Q3UWA4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim40Q3UWA4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim40Q3UWA4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim40Q3UWA4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim40Q3UWA4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim40Q3UWA4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim40Q3UWA4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim40Q3UWA4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim40Q3UWA4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim40Q3UWA4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim40Q3UWA4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim40Q3UWA4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim40Q3UWA4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim40Q3UWA4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim40Q3UWA4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim40Q3UWA4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim40Q3UWA4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim40Q3UWA4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim40Q3UWA4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim40Q3UWA4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim40Q3UWA4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim40Q3UWA4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim40Q3UWA4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim40Q3UWA4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim40Q3UWA4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim40Q3UWA4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim40Q3UWA4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim40Q3UWA4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim40Q3UWA4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim40Q3UWA4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim40Q3UWA4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim40Q3UWA4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim40Q3UWA4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim40Q3UWA4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim40Q3UWA4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim40Q3UWA4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim40Q3UWA4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim40Q3UWA4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim40Q3UWA4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim40Q3UWA4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim40Q3UWA4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim40Q3UWA4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim40Q3UWA4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim40Q3UWA4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim40Q3UWA4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim40Q3UWA4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim40Q3UWA4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim40Q3UWA4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim40Q3UWA4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim40Q3UWA4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim40Q3UWA4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim40Q3UWA4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim40Q3UWA4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim40Q3UWA4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim40Q3UWA4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim40Q3UWA4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim40Q3UWA4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Trim40Q3UWA4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim40Q3UWA4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim40Q3UWA4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trim40Q3UWA4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trim40Q3UWA4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trim40Q3UWA4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim40Q3UWA4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim40Q3UWA4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim40Q3UWA4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim40Q3UWA4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim40Q3UWA4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Trim40Q3UWA4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.7 ms