Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slfn4Q3UV66 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slfn4Q3UV66 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slfn4Q3UV66 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slfn4Q3UV66 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slfn4Q3UV66 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slfn4Q3UV66 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slfn4Q3UV66 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slfn4Q3UV66 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slfn4Q3UV66 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slfn4Q3UV66 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slfn4Q3UV66 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slfn4Q3UV66 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Slfn4Q3UV66 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slfn4Q3UV66 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slfn4Q3UV66 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Slfn4Q3UV66 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slfn4Q3UV66 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slfn4Q3UV66 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slfn4Q3UV66 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slfn4Q3UV66 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slfn4Q3UV66 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slfn4Q3UV66 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slfn4Q3UV66 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slfn4Q3UV66 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slfn4Q3UV66 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slfn4Q3UV66 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slfn4Q3UV66 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slfn4Q3UV66 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Slfn4Q3UV66 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slfn4Q3UV66 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slfn4Q3UV66 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slfn4Q3UV66 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slfn4Q3UV66 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slfn4Q3UV66 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slfn4Q3UV66 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slfn4Q3UV66 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slfn4Q3UV66 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slfn4Q3UV66 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slfn4Q3UV66 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slfn4Q3UV66 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slfn4Q3UV66 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slfn4Q3UV66 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slfn4Q3UV66 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slfn4Q3UV66 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slfn4Q3UV66 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slfn4Q3UV66 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slfn4Q3UV66 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slfn4Q3UV66 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slfn4Q3UV66 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slfn4Q3UV66 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slfn4Q3UV66 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slfn4Q3UV66 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slfn4Q3UV66 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slfn4Q3UV66 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Slfn4Q3UV66 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slfn4Q3UV66 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slfn4Q3UV66 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Slfn4Q3UV66 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slfn4Q3UV66 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slfn4Q3UV66 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slfn4Q3UV66 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slfn4Q3UV66 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slfn4Q3UV66 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slfn4Q3UV66 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slfn4Q3UV66 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slfn4Q3UV66 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slfn4Q3UV66 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slfn4Q3UV66 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slfn4Q3UV66 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slfn4Q3UV66 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slfn4Q3UV66 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slfn4Q3UV66 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slfn4Q3UV66 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slfn4Q3UV66 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slfn4Q3UV66 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slfn4Q3UV66 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slfn4Q3UV66 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slfn4Q3UV66 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slfn4Q3UV66 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slfn4Q3UV66 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slfn4Q3UV66 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slfn4Q3UV66 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slfn4Q3UV66 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slfn4Q3UV66 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slfn4Q3UV66 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slfn4Q3UV66 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slfn4Q3UV66 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slfn4Q3UV66 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slfn4Q3UV66 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slfn4Q3UV66 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slfn4Q3UV66 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slfn4Q3UV66 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slfn4Q3UV66 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slfn4Q3UV66 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slfn4Q3UV66 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slfn4Q3UV66 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slfn4Q3UV66 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slfn4Q3UV66 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slfn4Q3UV66 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms