Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Chpf2Q3UU43 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Chpf2Q3UU43 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Chpf2Q3UU43 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Chpf2Q3UU43 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Chpf2Q3UU43 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Chpf2Q3UU43 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Chpf2Q3UU43 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Chpf2Q3UU43 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Chpf2Q3UU43 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Chpf2Q3UU43 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Chpf2Q3UU43 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Chpf2Q3UU43 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Chpf2Q3UU43 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Chpf2Q3UU43 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Chpf2Q3UU43 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Chpf2Q3UU43 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Chpf2Q3UU43 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Chpf2Q3UU43 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Chpf2Q3UU43 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Chpf2Q3UU43 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Chpf2Q3UU43 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Chpf2Q3UU43 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Chpf2Q3UU43 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Chpf2Q3UU43 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Chpf2Q3UU43 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Chpf2Q3UU43 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Chpf2Q3UU43 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Chpf2Q3UU43 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Chpf2Q3UU43 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Chpf2Q3UU43 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Chpf2Q3UU43 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Chpf2Q3UU43 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Chpf2Q3UU43 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Chpf2Q3UU43 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Chpf2Q3UU43 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Chpf2Q3UU43 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Chpf2Q3UU43 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Chpf2Q3UU43 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Chpf2Q3UU43 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Chpf2Q3UU43 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Chpf2Q3UU43 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Chpf2Q3UU43 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Chpf2Q3UU43 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Chpf2Q3UU43 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Chpf2Q3UU43 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Chpf2Q3UU43 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Chpf2Q3UU43 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Chpf2Q3UU43 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Chpf2Q3UU43 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Chpf2Q3UU43 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Chpf2Q3UU43 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Chpf2Q3UU43 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Chpf2Q3UU43 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Chpf2Q3UU43 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Chpf2Q3UU43 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Chpf2Q3UU43 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Chpf2Q3UU43 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Chpf2Q3UU43 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Chpf2Q3UU43 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Chpf2Q3UU43 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Chpf2Q3UU43 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Chpf2Q3UU43 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Chpf2Q3UU43 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Chpf2Q3UU43 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Chpf2Q3UU43 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Chpf2Q3UU43 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Chpf2Q3UU43 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Chpf2Q3UU43 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Chpf2Q3UU43 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Chpf2Q3UU43 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Chpf2Q3UU43 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Chpf2Q3UU43 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Chpf2Q3UU43 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Chpf2Q3UU43 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Chpf2Q3UU43 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Chpf2Q3UU43 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Chpf2Q3UU43 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Chpf2Q3UU43 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Chpf2Q3UU43 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Chpf2Q3UU43 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Chpf2Q3UU43 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Chpf2Q3UU43 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Chpf2Q3UU43 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Chpf2Q3UU43 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Chpf2Q3UU43 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Chpf2Q3UU43 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Chpf2Q3UU43 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Chpf2Q3UU43 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Chpf2Q3UU43 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Chpf2Q3UU43 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Chpf2Q3UU43 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Chpf2Q3UU43 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Chpf2Q3UU43 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Chpf2Q3UU43 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Chpf2Q3UU43 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Chpf2Q3UU43 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Chpf2Q3UU43 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Chpf2Q3UU43 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Chpf2Q3UU43 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms