Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TceancQ3US16 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TceancQ3US16 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TceancQ3US16 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TceancQ3US16 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TceancQ3US16 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TceancQ3US16 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TceancQ3US16 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TceancQ3US16 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TceancQ3US16 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TceancQ3US16 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TceancQ3US16 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TceancQ3US16 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TceancQ3US16 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TceancQ3US16 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TceancQ3US16 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TceancQ3US16 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TceancQ3US16 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TceancQ3US16 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TceancQ3US16 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TceancQ3US16 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TceancQ3US16 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TceancQ3US16 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TceancQ3US16 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TceancQ3US16 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TceancQ3US16 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TceancQ3US16 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TceancQ3US16 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TceancQ3US16 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TceancQ3US16 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TceancQ3US16 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TceancQ3US16 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TceancQ3US16 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TceancQ3US16 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TceancQ3US16 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TceancQ3US16 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TceancQ3US16 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TceancQ3US16 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TceancQ3US16 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TceancQ3US16 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TceancQ3US16 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TceancQ3US16 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TceancQ3US16 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TceancQ3US16 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TceancQ3US16 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TceancQ3US16 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TceancQ3US16 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TceancQ3US16 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TceancQ3US16 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TceancQ3US16 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TceancQ3US16 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TceancQ3US16 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TceancQ3US16 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TceancQ3US16 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TceancQ3US16 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TceancQ3US16 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TceancQ3US16 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TceancQ3US16 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TceancQ3US16 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TceancQ3US16 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TceancQ3US16 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TceancQ3US16 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TceancQ3US16 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TceancQ3US16 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TceancQ3US16 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TceancQ3US16 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TceancQ3US16 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TceancQ3US16 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TceancQ3US16 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TceancQ3US16 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TceancQ3US16 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TceancQ3US16 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TceancQ3US16 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TceancQ3US16 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TceancQ3US16 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TceancQ3US16 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TceancQ3US16 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TceancQ3US16 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TceancQ3US16 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TceancQ3US16 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TceancQ3US16 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TceancQ3US16 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TceancQ3US16 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TceancQ3US16 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TceancQ3US16 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TceancQ3US16 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TceancQ3US16 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TceancQ3US16 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TceancQ3US16 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TceancQ3US16 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TceancQ3US16 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TceancQ3US16 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TceancQ3US16 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TceancQ3US16 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TceancQ3US16 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TceancQ3US16 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TceancQ3US16 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TceancQ3US16 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TceancQ3US16 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TceancQ3US16 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.1 ms