Protein–RNA interactions for Protein: Q3URF8

Kctd21, BTB/POZ domain-containing protein KCTD21, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd21Q3URF8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kctd21Q3URF8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kctd21Q3URF8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kctd21Q3URF8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Kctd21Q3URF8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kctd21Q3URF8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kctd21Q3URF8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kctd21Q3URF8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kctd21Q3URF8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kctd21Q3URF8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kctd21Q3URF8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kctd21Q3URF8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kctd21Q3URF8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kctd21Q3URF8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kctd21Q3URF8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kctd21Q3URF8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kctd21Q3URF8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kctd21Q3URF8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kctd21Q3URF8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kctd21Q3URF8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kctd21Q3URF8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kctd21Q3URF8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kctd21Q3URF8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Kctd21Q3URF8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kctd21Q3URF8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kctd21Q3URF8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kctd21Q3URF8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kctd21Q3URF8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Kctd21Q3URF8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kctd21Q3URF8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kctd21Q3URF8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kctd21Q3URF8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kctd21Q3URF8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kctd21Q3URF8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kctd21Q3URF8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kctd21Q3URF8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kctd21Q3URF8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kctd21Q3URF8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kctd21Q3URF8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kctd21Q3URF8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kctd21Q3URF8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kctd21Q3URF8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kctd21Q3URF8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kctd21Q3URF8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kctd21Q3URF8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kctd21Q3URF8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Kctd21Q3URF8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kctd21Q3URF8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kctd21Q3URF8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Kctd21Q3URF8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Kctd21Q3URF8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kctd21Q3URF8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kctd21Q3URF8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kctd21Q3URF8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kctd21Q3URF8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kctd21Q3URF8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kctd21Q3URF8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kctd21Q3URF8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Kctd21Q3URF8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Kctd21Q3URF8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kctd21Q3URF8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Kctd21Q3URF8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kctd21Q3URF8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kctd21Q3URF8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kctd21Q3URF8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kctd21Q3URF8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kctd21Q3URF8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kctd21Q3URF8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kctd21Q3URF8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kctd21Q3URF8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kctd21Q3URF8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kctd21Q3URF8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Kctd21Q3URF8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kctd21Q3URF8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kctd21Q3URF8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kctd21Q3URF8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kctd21Q3URF8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kctd21Q3URF8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kctd21Q3URF8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kctd21Q3URF8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kctd21Q3URF8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kctd21Q3URF8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kctd21Q3URF8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kctd21Q3URF8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kctd21Q3URF8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kctd21Q3URF8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kctd21Q3URF8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kctd21Q3URF8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kctd21Q3URF8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kctd21Q3URF8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Kctd21Q3URF8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kctd21Q3URF8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kctd21Q3URF8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kctd21Q3URF8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kctd21Q3URF8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kctd21Q3URF8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kctd21Q3URF8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Kctd21Q3URF8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kctd21Q3URF8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kctd21Q3URF8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106 ms