Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
D13Ertd608eQ3UPR8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
D13Ertd608eQ3UPR8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
D13Ertd608eQ3UPR8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
D13Ertd608eQ3UPR8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
D13Ertd608eQ3UPR8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
D13Ertd608eQ3UPR8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
D13Ertd608eQ3UPR8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
D13Ertd608eQ3UPR8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
D13Ertd608eQ3UPR8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
D13Ertd608eQ3UPR8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
D13Ertd608eQ3UPR8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
D13Ertd608eQ3UPR8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
D13Ertd608eQ3UPR8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
D13Ertd608eQ3UPR8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
D13Ertd608eQ3UPR8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
D13Ertd608eQ3UPR8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
D13Ertd608eQ3UPR8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
D13Ertd608eQ3UPR8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
D13Ertd608eQ3UPR8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
D13Ertd608eQ3UPR8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
D13Ertd608eQ3UPR8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
D13Ertd608eQ3UPR8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
D13Ertd608eQ3UPR8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
D13Ertd608eQ3UPR8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
D13Ertd608eQ3UPR8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
D13Ertd608eQ3UPR8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
D13Ertd608eQ3UPR8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
D13Ertd608eQ3UPR8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
D13Ertd608eQ3UPR8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
D13Ertd608eQ3UPR8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
D13Ertd608eQ3UPR8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
D13Ertd608eQ3UPR8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
D13Ertd608eQ3UPR8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
D13Ertd608eQ3UPR8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
D13Ertd608eQ3UPR8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
D13Ertd608eQ3UPR8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
D13Ertd608eQ3UPR8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
D13Ertd608eQ3UPR8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
D13Ertd608eQ3UPR8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
D13Ertd608eQ3UPR8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
D13Ertd608eQ3UPR8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
D13Ertd608eQ3UPR8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
D13Ertd608eQ3UPR8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
D13Ertd608eQ3UPR8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
D13Ertd608eQ3UPR8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
D13Ertd608eQ3UPR8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
D13Ertd608eQ3UPR8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
D13Ertd608eQ3UPR8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
D13Ertd608eQ3UPR8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
D13Ertd608eQ3UPR8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
D13Ertd608eQ3UPR8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
D13Ertd608eQ3UPR8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
D13Ertd608eQ3UPR8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
D13Ertd608eQ3UPR8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
D13Ertd608eQ3UPR8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
D13Ertd608eQ3UPR8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
D13Ertd608eQ3UPR8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
D13Ertd608eQ3UPR8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
D13Ertd608eQ3UPR8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
D13Ertd608eQ3UPR8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
D13Ertd608eQ3UPR8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
D13Ertd608eQ3UPR8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
D13Ertd608eQ3UPR8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
D13Ertd608eQ3UPR8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
D13Ertd608eQ3UPR8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
D13Ertd608eQ3UPR8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
D13Ertd608eQ3UPR8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
D13Ertd608eQ3UPR8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
D13Ertd608eQ3UPR8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
D13Ertd608eQ3UPR8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
D13Ertd608eQ3UPR8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
D13Ertd608eQ3UPR8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
D13Ertd608eQ3UPR8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
D13Ertd608eQ3UPR8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
D13Ertd608eQ3UPR8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
D13Ertd608eQ3UPR8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.8 ms