Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPP8

Cep63, Centrosomal protein of 63 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep63Q3UPP8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cep63Q3UPP8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cep63Q3UPP8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cep63Q3UPP8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Cep63Q3UPP8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cep63Q3UPP8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cep63Q3UPP8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Cep63Q3UPP8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cep63Q3UPP8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cep63Q3UPP8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cep63Q3UPP8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cep63Q3UPP8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cep63Q3UPP8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cep63Q3UPP8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cep63Q3UPP8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cep63Q3UPP8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cep63Q3UPP8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cep63Q3UPP8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cep63Q3UPP8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cep63Q3UPP8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cep63Q3UPP8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cep63Q3UPP8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cep63Q3UPP8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cep63Q3UPP8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cep63Q3UPP8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cep63Q3UPP8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cep63Q3UPP8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cep63Q3UPP8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cep63Q3UPP8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cep63Q3UPP8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cep63Q3UPP8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cep63Q3UPP8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cep63Q3UPP8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cep63Q3UPP8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cep63Q3UPP8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cep63Q3UPP8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cep63Q3UPP8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cep63Q3UPP8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cep63Q3UPP8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cep63Q3UPP8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cep63Q3UPP8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cep63Q3UPP8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Cep63Q3UPP8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cep63Q3UPP8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Cep63Q3UPP8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cep63Q3UPP8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cep63Q3UPP8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cep63Q3UPP8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cep63Q3UPP8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Cep63Q3UPP8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cep63Q3UPP8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cep63Q3UPP8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cep63Q3UPP8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cep63Q3UPP8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cep63Q3UPP8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cep63Q3UPP8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cep63Q3UPP8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cep63Q3UPP8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cep63Q3UPP8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cep63Q3UPP8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cep63Q3UPP8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cep63Q3UPP8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cep63Q3UPP8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cep63Q3UPP8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Cep63Q3UPP8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cep63Q3UPP8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cep63Q3UPP8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cep63Q3UPP8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cep63Q3UPP8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cep63Q3UPP8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cep63Q3UPP8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cep63Q3UPP8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Cep63Q3UPP8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cep63Q3UPP8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cep63Q3UPP8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cep63Q3UPP8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cep63Q3UPP8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cep63Q3UPP8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cep63Q3UPP8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cep63Q3UPP8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cep63Q3UPP8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cep63Q3UPP8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cep63Q3UPP8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Cep63Q3UPP8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cep63Q3UPP8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cep63Q3UPP8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cep63Q3UPP8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cep63Q3UPP8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Cep63Q3UPP8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cep63Q3UPP8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cep63Q3UPP8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cep63Q3UPP8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cep63Q3UPP8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cep63Q3UPP8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cep63Q3UPP8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cep63Q3UPP8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Cep63Q3UPP8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cep63Q3UPP8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cep63Q3UPP8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cep63Q3UPP8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms