Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Sf3b2Q3UJB0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Sf3b2Q3UJB0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Sf3b2Q3UJB0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Sf3b2Q3UJB0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Sf3b2Q3UJB0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Sf3b2Q3UJB0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Sf3b2Q3UJB0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Sf3b2Q3UJB0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Sf3b2Q3UJB0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Sf3b2Q3UJB0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
Sf3b2Q3UJB0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Sf3b2Q3UJB0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Sf3b2Q3UJB0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Sf3b2Q3UJB0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Sf3b2Q3UJB0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Sf3b2Q3UJB0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Sf3b2Q3UJB0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Sf3b2Q3UJB0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Sf3b2Q3UJB0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Sf3b2Q3UJB0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Sf3b2Q3UJB0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Sf3b2Q3UJB0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Sf3b2Q3UJB0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Sf3b2Q3UJB0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Sf3b2Q3UJB0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Sf3b2Q3UJB0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Sf3b2Q3UJB0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Sf3b2Q3UJB0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Sf3b2Q3UJB0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Sf3b2Q3UJB0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Sf3b2Q3UJB0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Sf3b2Q3UJB0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Sf3b2Q3UJB0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Sf3b2Q3UJB0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Sf3b2Q3UJB0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Sf3b2Q3UJB0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Sf3b2Q3UJB0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Sf3b2Q3UJB0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Sf3b2Q3UJB0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Sf3b2Q3UJB0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Sf3b2Q3UJB0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Sf3b2Q3UJB0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Sf3b2Q3UJB0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Sf3b2Q3UJB0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Sf3b2Q3UJB0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Sf3b2Q3UJB0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Sf3b2Q3UJB0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Sf3b2Q3UJB0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Sf3b2Q3UJB0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Sf3b2Q3UJB0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Sf3b2Q3UJB0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Sf3b2Q3UJB0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Sf3b2Q3UJB0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Sf3b2Q3UJB0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Sf3b2Q3UJB0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Sf3b2Q3UJB0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Sf3b2Q3UJB0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Sf3b2Q3UJB0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Sf3b2Q3UJB0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Sf3b2Q3UJB0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Sf3b2Q3UJB0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Sf3b2Q3UJB0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Sf3b2Q3UJB0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Sf3b2Q3UJB0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Sf3b2Q3UJB0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Sf3b2Q3UJB0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Sf3b2Q3UJB0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Sf3b2Q3UJB0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Sf3b2Q3UJB0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Sf3b2Q3UJB0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Sf3b2Q3UJB0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Sf3b2Q3UJB0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Sf3b2Q3UJB0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Sf3b2Q3UJB0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Sf3b2Q3UJB0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Sf3b2Q3UJB0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Sf3b2Q3UJB0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Sf3b2Q3UJB0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Sf3b2Q3UJB0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Sf3b2Q3UJB0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Sf3b2Q3UJB0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Sf3b2Q3UJB0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Sf3b2Q3UJB0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Sf3b2Q3UJB0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Sf3b2Q3UJB0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Sf3b2Q3UJB0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Sf3b2Q3UJB0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Sf3b2Q3UJB0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Sf3b2Q3UJB0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Sf3b2Q3UJB0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Sf3b2Q3UJB0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Sf3b2Q3UJB0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Sf3b2Q3UJB0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Sf3b2Q3UJB0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Sf3b2Q3UJB0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Sf3b2Q3UJB0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Sf3b2Q3UJB0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.2 ms