Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nkx6-3Q3UHX8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nkx6-3Q3UHX8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nkx6-3Q3UHX8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nkx6-3Q3UHX8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nkx6-3Q3UHX8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nkx6-3Q3UHX8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nkx6-3Q3UHX8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nkx6-3Q3UHX8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nkx6-3Q3UHX8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nkx6-3Q3UHX8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nkx6-3Q3UHX8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nkx6-3Q3UHX8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nkx6-3Q3UHX8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nkx6-3Q3UHX8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkx6-3Q3UHX8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkx6-3Q3UHX8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkx6-3Q3UHX8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nkx6-3Q3UHX8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nkx6-3Q3UHX8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nkx6-3Q3UHX8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nkx6-3Q3UHX8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nkx6-3Q3UHX8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nkx6-3Q3UHX8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nkx6-3Q3UHX8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nkx6-3Q3UHX8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nkx6-3Q3UHX8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkx6-3Q3UHX8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkx6-3Q3UHX8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkx6-3Q3UHX8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkx6-3Q3UHX8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkx6-3Q3UHX8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkx6-3Q3UHX8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkx6-3Q3UHX8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkx6-3Q3UHX8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkx6-3Q3UHX8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nkx6-3Q3UHX8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nkx6-3Q3UHX8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nkx6-3Q3UHX8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nkx6-3Q3UHX8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nkx6-3Q3UHX8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Nkx6-3Q3UHX8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Nkx6-3Q3UHX8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nkx6-3Q3UHX8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nkx6-3Q3UHX8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nkx6-3Q3UHX8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nkx6-3Q3UHX8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nkx6-3Q3UHX8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nkx6-3Q3UHX8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nkx6-3Q3UHX8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nkx6-3Q3UHX8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nkx6-3Q3UHX8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nkx6-3Q3UHX8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nkx6-3Q3UHX8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nkx6-3Q3UHX8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Nkx6-3Q3UHX8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nkx6-3Q3UHX8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nkx6-3Q3UHX8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nkx6-3Q3UHX8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nkx6-3Q3UHX8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nkx6-3Q3UHX8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nkx6-3Q3UHX8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nkx6-3Q3UHX8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Nkx6-3Q3UHX8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nkx6-3Q3UHX8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nkx6-3Q3UHX8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nkx6-3Q3UHX8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nkx6-3Q3UHX8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nkx6-3Q3UHX8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nkx6-3Q3UHX8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nkx6-3Q3UHX8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nkx6-3Q3UHX8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nkx6-3Q3UHX8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nkx6-3Q3UHX8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nkx6-3Q3UHX8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nkx6-3Q3UHX8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nkx6-3Q3UHX8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Nkx6-3Q3UHX8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nkx6-3Q3UHX8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nkx6-3Q3UHX8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nkx6-3Q3UHX8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nkx6-3Q3UHX8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nkx6-3Q3UHX8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nkx6-3Q3UHX8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nkx6-3Q3UHX8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nkx6-3Q3UHX8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nkx6-3Q3UHX8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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