Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Greb1Q3UHK3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Greb1Q3UHK3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Greb1Q3UHK3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Greb1Q3UHK3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Greb1Q3UHK3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Greb1Q3UHK3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Greb1Q3UHK3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Greb1Q3UHK3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Greb1Q3UHK3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Greb1Q3UHK3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Greb1Q3UHK3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Greb1Q3UHK3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Greb1Q3UHK3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Greb1Q3UHK3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Greb1Q3UHK3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Greb1Q3UHK3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Greb1Q3UHK3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Greb1Q3UHK3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Greb1Q3UHK3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Greb1Q3UHK3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Greb1Q3UHK3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Greb1Q3UHK3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Greb1Q3UHK3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Greb1Q3UHK3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Greb1Q3UHK3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Greb1Q3UHK3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Greb1Q3UHK3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Greb1Q3UHK3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Greb1Q3UHK3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Greb1Q3UHK3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Greb1Q3UHK3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Greb1Q3UHK3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Greb1Q3UHK3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Greb1Q3UHK3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Greb1Q3UHK3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Greb1Q3UHK3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Greb1Q3UHK3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Greb1Q3UHK3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Greb1Q3UHK3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Greb1Q3UHK3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Greb1Q3UHK3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Greb1Q3UHK3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Greb1Q3UHK3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Greb1Q3UHK3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Greb1Q3UHK3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Greb1Q3UHK3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Greb1Q3UHK3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Greb1Q3UHK3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Greb1Q3UHK3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Greb1Q3UHK3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Greb1Q3UHK3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Greb1Q3UHK3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Greb1Q3UHK3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Greb1Q3UHK3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Greb1Q3UHK3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Greb1Q3UHK3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Greb1Q3UHK3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Greb1Q3UHK3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Greb1Q3UHK3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Greb1Q3UHK3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Greb1Q3UHK3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Greb1Q3UHK3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Greb1Q3UHK3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Greb1Q3UHK3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Greb1Q3UHK3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Greb1Q3UHK3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Greb1Q3UHK3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Greb1Q3UHK3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Greb1Q3UHK3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Greb1Q3UHK3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Greb1Q3UHK3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Greb1Q3UHK3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Greb1Q3UHK3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Greb1Q3UHK3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Greb1Q3UHK3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Greb1Q3UHK3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Greb1Q3UHK3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Greb1Q3UHK3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Greb1Q3UHK3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Greb1Q3UHK3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Greb1Q3UHK3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Greb1Q3UHK3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Greb1Q3UHK3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Greb1Q3UHK3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Greb1Q3UHK3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Greb1Q3UHK3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Greb1Q3UHK3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Greb1Q3UHK3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Greb1Q3UHK3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Greb1Q3UHK3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Greb1Q3UHK3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Greb1Q3UHK3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Greb1Q3UHK3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Greb1Q3UHK3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Greb1Q3UHK3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Greb1Q3UHK3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Greb1Q3UHK3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Greb1Q3UHK3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Greb1Q3UHK3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms