Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI4

Tmed8, Protein TMED8, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed8Q3UHI4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tmed8Q3UHI4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tmed8Q3UHI4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tmed8Q3UHI4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tmed8Q3UHI4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Tmed8Q3UHI4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Tmed8Q3UHI4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tmed8Q3UHI4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tmed8Q3UHI4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tmed8Q3UHI4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tmed8Q3UHI4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tmed8Q3UHI4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tmed8Q3UHI4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tmed8Q3UHI4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tmed8Q3UHI4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tmed8Q3UHI4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tmed8Q3UHI4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tmed8Q3UHI4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tmed8Q3UHI4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tmed8Q3UHI4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tmed8Q3UHI4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tmed8Q3UHI4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Tmed8Q3UHI4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tmed8Q3UHI4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tmed8Q3UHI4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tmed8Q3UHI4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tmed8Q3UHI4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tmed8Q3UHI4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tmed8Q3UHI4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Tmed8Q3UHI4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tmed8Q3UHI4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tmed8Q3UHI4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tmed8Q3UHI4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tmed8Q3UHI4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tmed8Q3UHI4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tmed8Q3UHI4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tmed8Q3UHI4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tmed8Q3UHI4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tmed8Q3UHI4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tmed8Q3UHI4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tmed8Q3UHI4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tmed8Q3UHI4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tmed8Q3UHI4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tmed8Q3UHI4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tmed8Q3UHI4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tmed8Q3UHI4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tmed8Q3UHI4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tmed8Q3UHI4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tmed8Q3UHI4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tmed8Q3UHI4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tmed8Q3UHI4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tmed8Q3UHI4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tmed8Q3UHI4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tmed8Q3UHI4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tmed8Q3UHI4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tmed8Q3UHI4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tmed8Q3UHI4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tmed8Q3UHI4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Tmed8Q3UHI4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tmed8Q3UHI4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tmed8Q3UHI4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tmed8Q3UHI4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tmed8Q3UHI4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tmed8Q3UHI4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tmed8Q3UHI4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tmed8Q3UHI4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tmed8Q3UHI4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Tmed8Q3UHI4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Tmed8Q3UHI4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tmed8Q3UHI4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Tmed8Q3UHI4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Tmed8Q3UHI4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tmed8Q3UHI4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tmed8Q3UHI4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tmed8Q3UHI4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tmed8Q3UHI4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tmed8Q3UHI4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tmed8Q3UHI4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tmed8Q3UHI4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tmed8Q3UHI4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tmed8Q3UHI4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tmed8Q3UHI4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Tmed8Q3UHI4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Tmed8Q3UHI4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Tmed8Q3UHI4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tmed8Q3UHI4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tmed8Q3UHI4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tmed8Q3UHI4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Tmed8Q3UHI4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tmed8Q3UHI4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tmed8Q3UHI4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tmed8Q3UHI4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tmed8Q3UHI4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tmed8Q3UHI4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Tmed8Q3UHI4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tmed8Q3UHI4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tmed8Q3UHI4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tmed8Q3UHI4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tmed8Q3UHI4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tmed8Q3UHI4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms