Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rsph3aQ3UFY4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rsph3aQ3UFY4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Rsph3aQ3UFY4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rsph3aQ3UFY4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rsph3aQ3UFY4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rsph3aQ3UFY4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rsph3aQ3UFY4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rsph3aQ3UFY4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rsph3aQ3UFY4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rsph3aQ3UFY4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rsph3aQ3UFY4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rsph3aQ3UFY4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rsph3aQ3UFY4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rsph3aQ3UFY4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rsph3aQ3UFY4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rsph3aQ3UFY4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rsph3aQ3UFY4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rsph3aQ3UFY4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rsph3aQ3UFY4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rsph3aQ3UFY4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rsph3aQ3UFY4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rsph3aQ3UFY4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rsph3aQ3UFY4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Rsph3aQ3UFY4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rsph3aQ3UFY4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rsph3aQ3UFY4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rsph3aQ3UFY4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rsph3aQ3UFY4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rsph3aQ3UFY4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rsph3aQ3UFY4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rsph3aQ3UFY4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rsph3aQ3UFY4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rsph3aQ3UFY4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rsph3aQ3UFY4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rsph3aQ3UFY4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rsph3aQ3UFY4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rsph3aQ3UFY4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rsph3aQ3UFY4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rsph3aQ3UFY4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rsph3aQ3UFY4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rsph3aQ3UFY4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rsph3aQ3UFY4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rsph3aQ3UFY4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rsph3aQ3UFY4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rsph3aQ3UFY4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Rsph3aQ3UFY4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rsph3aQ3UFY4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Rsph3aQ3UFY4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rsph3aQ3UFY4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rsph3aQ3UFY4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Rsph3aQ3UFY4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rsph3aQ3UFY4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rsph3aQ3UFY4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rsph3aQ3UFY4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rsph3aQ3UFY4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rsph3aQ3UFY4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rsph3aQ3UFY4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rsph3aQ3UFY4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rsph3aQ3UFY4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rsph3aQ3UFY4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rsph3aQ3UFY4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rsph3aQ3UFY4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rsph3aQ3UFY4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rsph3aQ3UFY4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rsph3aQ3UFY4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rsph3aQ3UFY4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rsph3aQ3UFY4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rsph3aQ3UFY4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rsph3aQ3UFY4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Rsph3aQ3UFY4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rsph3aQ3UFY4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rsph3aQ3UFY4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rsph3aQ3UFY4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rsph3aQ3UFY4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rsph3aQ3UFY4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rsph3aQ3UFY4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Rsph3aQ3UFY4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rsph3aQ3UFY4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rsph3aQ3UFY4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rsph3aQ3UFY4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rsph3aQ3UFY4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rsph3aQ3UFY4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rsph3aQ3UFY4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Rsph3aQ3UFY4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rsph3aQ3UFY4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rsph3aQ3UFY4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Rsph3aQ3UFY4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rsph3aQ3UFY4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rsph3aQ3UFY4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rsph3aQ3UFY4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rsph3aQ3UFY4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Rsph3aQ3UFY4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rsph3aQ3UFY4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rsph3aQ3UFY4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rsph3aQ3UFY4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rsph3aQ3UFY4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rsph3aQ3UFY4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rsph3aQ3UFY4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rsph3aQ3UFY4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms