Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3U595 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3U595 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3U595 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3U595 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3U595 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3U595 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3U595 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3U595 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3U595 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3U595 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3U595 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3U595 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q3U595 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q3U595 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3U595 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3U595 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3U595 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3U595 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3U595 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q3U595 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q3U595 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q3U595 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q3U595 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q3U595 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q3U595 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3U595 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3U595 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3U595 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q3U595 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q3U595 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q3U595 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q3U595 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q3U595 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q3U595 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q3U595 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q3U595 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q3U595 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q3U595 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q3U595 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q3U595 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q3U595 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q3U595 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q3U595 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q3U595 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q3U595 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q3U595 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q3U595 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q3U595 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q3U595 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q3U595 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q3U595 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q3U595 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q3U595 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q3U595 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q3U595 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q3U595 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q3U595 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q3U595 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q3U595 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q3U595 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q3U595 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q3U595 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q3U595 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q3U595 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q3U595 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q3U595 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q3U595 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q3U595 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q3U595 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q3U595 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q3U595 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q3U595 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q3U595 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q3U595 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q3U595 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q3U595 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q3U595 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q3U595 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q3U595 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q3U595 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q3U595 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q3U595 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Q3U595 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q3U595 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q3U595 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Q3U595 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q3U595 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q3U595 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q3U595 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q3U595 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q3U595 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q3U595 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q3U595 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q3U595 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q3U595 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q3U595 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q3U595 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q3U595 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q3U595 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms