Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K0

Fam193b, Protein FAM193B, mousemouse

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam193bQ3U2K0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam193bQ3U2K0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam193bQ3U2K0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam193bQ3U2K0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam193bQ3U2K0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam193bQ3U2K0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam193bQ3U2K0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam193bQ3U2K0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam193bQ3U2K0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam193bQ3U2K0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam193bQ3U2K0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam193bQ3U2K0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam193bQ3U2K0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam193bQ3U2K0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam193bQ3U2K0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam193bQ3U2K0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam193bQ3U2K0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam193bQ3U2K0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam193bQ3U2K0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam193bQ3U2K0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam193bQ3U2K0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam193bQ3U2K0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam193bQ3U2K0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam193bQ3U2K0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam193bQ3U2K0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam193bQ3U2K0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam193bQ3U2K0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam193bQ3U2K0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam193bQ3U2K0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam193bQ3U2K0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam193bQ3U2K0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam193bQ3U2K0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam193bQ3U2K0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam193bQ3U2K0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam193bQ3U2K0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam193bQ3U2K0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam193bQ3U2K0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam193bQ3U2K0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam193bQ3U2K0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam193bQ3U2K0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam193bQ3U2K0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam193bQ3U2K0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam193bQ3U2K0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam193bQ3U2K0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam193bQ3U2K0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam193bQ3U2K0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam193bQ3U2K0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam193bQ3U2K0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam193bQ3U2K0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam193bQ3U2K0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam193bQ3U2K0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam193bQ3U2K0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam193bQ3U2K0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam193bQ3U2K0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam193bQ3U2K0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam193bQ3U2K0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam193bQ3U2K0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam193bQ3U2K0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam193bQ3U2K0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam193bQ3U2K0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam193bQ3U2K0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Fam193bQ3U2K0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam193bQ3U2K0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam193bQ3U2K0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam193bQ3U2K0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam193bQ3U2K0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam193bQ3U2K0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam193bQ3U2K0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam193bQ3U2K0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam193bQ3U2K0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam193bQ3U2K0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam193bQ3U2K0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam193bQ3U2K0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam193bQ3U2K0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam193bQ3U2K0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam193bQ3U2K0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam193bQ3U2K0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam193bQ3U2K0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fam193bQ3U2K0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam193bQ3U2K0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam193bQ3U2K0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam193bQ3U2K0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam193bQ3U2K0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam193bQ3U2K0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam193bQ3U2K0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam193bQ3U2K0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam193bQ3U2K0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam193bQ3U2K0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam193bQ3U2K0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam193bQ3U2K0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam193bQ3U2K0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam193bQ3U2K0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam193bQ3U2K0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam193bQ3U2K0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam193bQ3U2K0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam193bQ3U2K0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam193bQ3U2K0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam193bQ3U2K0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam193bQ3U2K0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam193bQ3U2K0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms