Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0S6

Rasip1, Ras-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasip1Q3U0S6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rasip1Q3U0S6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rasip1Q3U0S6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rasip1Q3U0S6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rasip1Q3U0S6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rasip1Q3U0S6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rasip1Q3U0S6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Rasip1Q3U0S6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rasip1Q3U0S6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rasip1Q3U0S6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Rasip1Q3U0S6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rasip1Q3U0S6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rasip1Q3U0S6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rasip1Q3U0S6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rasip1Q3U0S6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rasip1Q3U0S6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rasip1Q3U0S6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rasip1Q3U0S6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rasip1Q3U0S6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Rasip1Q3U0S6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rasip1Q3U0S6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rasip1Q3U0S6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Rasip1Q3U0S6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rasip1Q3U0S6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rasip1Q3U0S6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rasip1Q3U0S6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rasip1Q3U0S6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rasip1Q3U0S6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rasip1Q3U0S6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Rasip1Q3U0S6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rasip1Q3U0S6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rasip1Q3U0S6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rasip1Q3U0S6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Rasip1Q3U0S6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rasip1Q3U0S6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rasip1Q3U0S6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rasip1Q3U0S6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rasip1Q3U0S6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rasip1Q3U0S6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rasip1Q3U0S6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rasip1Q3U0S6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rasip1Q3U0S6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Rasip1Q3U0S6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rasip1Q3U0S6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rasip1Q3U0S6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rasip1Q3U0S6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rasip1Q3U0S6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rasip1Q3U0S6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rasip1Q3U0S6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rasip1Q3U0S6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rasip1Q3U0S6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rasip1Q3U0S6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rasip1Q3U0S6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rasip1Q3U0S6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rasip1Q3U0S6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rasip1Q3U0S6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rasip1Q3U0S6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Rasip1Q3U0S6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rasip1Q3U0S6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rasip1Q3U0S6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rasip1Q3U0S6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rasip1Q3U0S6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rasip1Q3U0S6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rasip1Q3U0S6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rasip1Q3U0S6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rasip1Q3U0S6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rasip1Q3U0S6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rasip1Q3U0S6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rasip1Q3U0S6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rasip1Q3U0S6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rasip1Q3U0S6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rasip1Q3U0S6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Rasip1Q3U0S6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rasip1Q3U0S6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rasip1Q3U0S6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rasip1Q3U0S6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rasip1Q3U0S6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rasip1Q3U0S6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rasip1Q3U0S6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rasip1Q3U0S6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rasip1Q3U0S6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rasip1Q3U0S6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rasip1Q3U0S6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rasip1Q3U0S6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rasip1Q3U0S6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rasip1Q3U0S6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rasip1Q3U0S6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rasip1Q3U0S6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Rasip1Q3U0S6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rasip1Q3U0S6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rasip1Q3U0S6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rasip1Q3U0S6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rasip1Q3U0S6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rasip1Q3U0S6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rasip1Q3U0S6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rasip1Q3U0S6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rasip1Q3U0S6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rasip1Q3U0S6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rasip1Q3U0S6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rasip1Q3U0S6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms