Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q3TTJ4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q3TTJ4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q3TTJ4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q3TTJ4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q3TTJ4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q3TTJ4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q3TTJ4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q3TTJ4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Q3TTJ4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q3TTJ4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q3TTJ4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q3TTJ4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q3TTJ4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Q3TTJ4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Q3TTJ4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Q3TTJ4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Q3TTJ4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q3TTJ4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q3TTJ4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q3TTJ4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q3TTJ4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q3TTJ4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q3TTJ4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q3TTJ4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q3TTJ4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q3TTJ4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q3TTJ4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q3TTJ4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q3TTJ4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q3TTJ4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q3TTJ4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q3TTJ4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q3TTJ4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Q3TTJ4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q3TTJ4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q3TTJ4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Q3TTJ4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Q3TTJ4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q3TTJ4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q3TTJ4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q3TTJ4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q3TTJ4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q3TTJ4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q3TTJ4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q3TTJ4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q3TTJ4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q3TTJ4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q3TTJ4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q3TTJ4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q3TTJ4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q3TTJ4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q3TTJ4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q3TTJ4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q3TTJ4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q3TTJ4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q3TTJ4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q3TTJ4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q3TTJ4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q3TTJ4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q3TTJ4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Q3TTJ4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q3TTJ4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q3TTJ4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q3TTJ4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q3TTJ4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q3TTJ4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q3TTJ4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q3TTJ4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q3TTJ4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q3TTJ4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q3TTJ4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q3TTJ4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q3TTJ4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q3TTJ4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q3TTJ4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q3TTJ4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q3TTJ4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q3TTJ4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q3TTJ4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q3TTJ4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q3TTJ4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q3TTJ4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q3TTJ4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q3TTJ4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Q3TTJ4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q3TTJ4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q3TTJ4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q3TTJ4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q3TTJ4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Q3TTJ4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q3TTJ4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q3TTJ4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q3TTJ4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q3TTJ4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q3TTJ4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q3TTJ4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q3TTJ4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q3TTJ4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q3TTJ4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms