Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC41,61■■■■■ 4,25
Smarca4Q3TKT4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC41,61■■■■■ 4,25
Smarca4Q3TKT4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC41,61■■■■■ 4,25
Smarca4Q3TKT4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,61■■■■■ 4,25
Smarca4Q3TKT4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41,6■■■■■ 4,25
Smarca4Q3TKT4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC41,59■■■■■ 4,25
Smarca4Q3TKT4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,59■■■■■ 4,25
Smarca4Q3TKT4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,58■■■■■ 4,25
Smarca4Q3TKT4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC41,58■■■■■ 4,25
Smarca4Q3TKT4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC41,58■■■■■ 4,25
Smarca4Q3TKT4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC41,57■■■■■ 4,25
Smarca4Q3TKT4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC41,57■■■■■ 4,25
Smarca4Q3TKT4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC41,55■■■■■ 4,24
Smarca4Q3TKT4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC41,55■■■■■ 4,24
Smarca4Q3TKT4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,55■■■■■ 4,24
Smarca4Q3TKT4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC41,55■■■■■ 4,24
Smarca4Q3TKT4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41,55■■■■■ 4,24
Smarca4Q3TKT4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC41,53■■■■■ 4,24
Smarca4Q3TKT4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC41,52■■■■■ 4,24
Smarca4Q3TKT4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC41,52■■■■■ 4,24
Smarca4Q3TKT4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,52■■■■■ 4,24
Smarca4Q3TKT4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,52■■■■■ 4,24
Smarca4Q3TKT4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41,51■■■■■ 4,24
Smarca4Q3TKT4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC41,51■■■■■ 4,24
Smarca4Q3TKT4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC41,51■■■■■ 4,24
Smarca4Q3TKT4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC41,51■■■■■ 4,24
Smarca4Q3TKT4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC41,51■■■■■ 4,24
Smarca4Q3TKT4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,5■■■■■ 4,23
Smarca4Q3TKT4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC41,5■■■■■ 4,23
Smarca4Q3TKT4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,5■■■■■ 4,23
Smarca4Q3TKT4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,5■■■■■ 4,23
Smarca4Q3TKT4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,49■■■■■ 4,23
Smarca4Q3TKT4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,48■■■■■ 4,23
Smarca4Q3TKT4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC41,47■■■■■ 4,23
Smarca4Q3TKT4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC41,47■■■■■ 4,23
Smarca4Q3TKT4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,47■■■■■ 4,23
Smarca4Q3TKT4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC41,47■■■■■ 4,23
Smarca4Q3TKT4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC41,45■■■■■ 4,23
Smarca4Q3TKT4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC41,44■■■■■ 4,22
Smarca4Q3TKT4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC41,44■■■■■ 4,22
Smarca4Q3TKT4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC41,44■■■■■ 4,22
Smarca4Q3TKT4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC41,44■■■■■ 4,22
Smarca4Q3TKT4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41,44■■■■■ 4,22
Smarca4Q3TKT4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,43■■■■■ 4,22
Smarca4Q3TKT4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41,43■■■■■ 4,22
Smarca4Q3TKT4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41,42■■■■■ 4,22
Smarca4Q3TKT4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,42■■■■■ 4,22
Smarca4Q3TKT4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC41,42■■■■■ 4,22
Smarca4Q3TKT4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,42■■■■■ 4,22
Smarca4Q3TKT4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC41,42■■■■■ 4,22
Smarca4Q3TKT4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC41,42■■■■■ 4,22
Smarca4Q3TKT4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC41,42■■■■■ 4,22
Smarca4Q3TKT4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC41,41■■■■■ 4,22
Smarca4Q3TKT4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41,41■■■■■ 4,22
Smarca4Q3TKT4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC41,4■■■■■ 4,22
Smarca4Q3TKT4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,39■■■■■ 4,22
Smarca4Q3TKT4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC41,39■■■■■ 4,22
Smarca4Q3TKT4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41,38■■■■■ 4,21
Smarca4Q3TKT4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,38■■■■■ 4,21
Smarca4Q3TKT4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC41,37■■■■■ 4,21
Smarca4Q3TKT4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC41,36■■■■■ 4,21
Smarca4Q3TKT4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC41,36■■■■■ 4,21
Smarca4Q3TKT4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC41,35■■■■■ 4,21
Smarca4Q3TKT4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC41,35■■■■■ 4,21
Smarca4Q3TKT4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,35■■■■■ 4,21
Smarca4Q3TKT4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41,34■■■■■ 4,21
Smarca4Q3TKT4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41,33■■■■■ 4,21
Smarca4Q3TKT4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,32■■■■■ 4,2
Smarca4Q3TKT4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,31■■■■■ 4,2
Smarca4Q3TKT4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41,31■■■■■ 4,2
Smarca4Q3TKT4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC41,3■■■■■ 4,2
Smarca4Q3TKT4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC41,29■■■■■ 4,2
Smarca4Q3TKT4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,29■■■■■ 4,2
Smarca4Q3TKT4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC41,29■■■■■ 4,2
Smarca4Q3TKT4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,29■■■■■ 4,2
Smarca4Q3TKT4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,29■■■■■ 4,2
Smarca4Q3TKT4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,29■■■■■ 4,2
Smarca4Q3TKT4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,28■■■■■ 4,2
Smarca4Q3TKT4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC41,27■■■■■ 4,2
Smarca4Q3TKT4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC41,27■■■■■ 4,2
Smarca4Q3TKT4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,27■■■■■ 4,2
Smarca4Q3TKT4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41,26■■■■■ 4,19
Smarca4Q3TKT4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,26■■■■■ 4,19
Smarca4Q3TKT4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC41,26■■■■■ 4,19
Smarca4Q3TKT4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,26■■■■■ 4,19
Smarca4Q3TKT4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,25■■■■■ 4,19
Smarca4Q3TKT4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC41,25■■■■■ 4,19
Smarca4Q3TKT4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41,25■■■■■ 4,19
Smarca4Q3TKT4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,23■■■■■ 4,19
Smarca4Q3TKT4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,22■■■■■ 4,19
Smarca4Q3TKT4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,21■■■■■ 4,19
Smarca4Q3TKT4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,21■■■■■ 4,19
Smarca4Q3TKT4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC41,21■■■■■ 4,19
Smarca4Q3TKT4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC41,21■■■■■ 4,19
Smarca4Q3TKT4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC41,2■■■■■ 4,19
Smarca4Q3TKT4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41,19■■■■■ 4,18
Smarca4Q3TKT4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41,19■■■■■ 4,18
Smarca4Q3TKT4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41,19■■■■■ 4,18
Smarca4Q3TKT4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC41,18■■■■■ 4,18
Smarca4Q3TKT4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC41,18■■■■■ 4,18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,8 ms