Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR3

Nlrp4c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4cQ3TKR3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlrp4cQ3TKR3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nlrp4cQ3TKR3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nlrp4cQ3TKR3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nlrp4cQ3TKR3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nlrp4cQ3TKR3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nlrp4cQ3TKR3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Nlrp4cQ3TKR3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nlrp4cQ3TKR3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nlrp4cQ3TKR3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nlrp4cQ3TKR3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nlrp4cQ3TKR3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nlrp4cQ3TKR3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nlrp4cQ3TKR3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nlrp4cQ3TKR3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nlrp4cQ3TKR3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nlrp4cQ3TKR3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nlrp4cQ3TKR3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nlrp4cQ3TKR3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nlrp4cQ3TKR3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nlrp4cQ3TKR3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nlrp4cQ3TKR3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nlrp4cQ3TKR3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nlrp4cQ3TKR3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nlrp4cQ3TKR3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nlrp4cQ3TKR3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nlrp4cQ3TKR3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nlrp4cQ3TKR3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nlrp4cQ3TKR3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nlrp4cQ3TKR3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nlrp4cQ3TKR3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nlrp4cQ3TKR3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nlrp4cQ3TKR3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nlrp4cQ3TKR3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nlrp4cQ3TKR3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nlrp4cQ3TKR3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nlrp4cQ3TKR3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nlrp4cQ3TKR3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nlrp4cQ3TKR3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nlrp4cQ3TKR3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nlrp4cQ3TKR3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Nlrp4cQ3TKR3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nlrp4cQ3TKR3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nlrp4cQ3TKR3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nlrp4cQ3TKR3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nlrp4cQ3TKR3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Nlrp4cQ3TKR3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nlrp4cQ3TKR3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nlrp4cQ3TKR3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nlrp4cQ3TKR3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nlrp4cQ3TKR3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nlrp4cQ3TKR3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nlrp4cQ3TKR3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nlrp4cQ3TKR3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nlrp4cQ3TKR3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nlrp4cQ3TKR3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nlrp4cQ3TKR3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nlrp4cQ3TKR3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nlrp4cQ3TKR3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nlrp4cQ3TKR3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nlrp4cQ3TKR3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nlrp4cQ3TKR3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Nlrp4cQ3TKR3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nlrp4cQ3TKR3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nlrp4cQ3TKR3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nlrp4cQ3TKR3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nlrp4cQ3TKR3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nlrp4cQ3TKR3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nlrp4cQ3TKR3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nlrp4cQ3TKR3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nlrp4cQ3TKR3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nlrp4cQ3TKR3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nlrp4cQ3TKR3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nlrp4cQ3TKR3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nlrp4cQ3TKR3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nlrp4cQ3TKR3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nlrp4cQ3TKR3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nlrp4cQ3TKR3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nlrp4cQ3TKR3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nlrp4cQ3TKR3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nlrp4cQ3TKR3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nlrp4cQ3TKR3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nlrp4cQ3TKR3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nlrp4cQ3TKR3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Nlrp4cQ3TKR3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlrp4cQ3TKR3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlrp4cQ3TKR3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlrp4cQ3TKR3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlrp4cQ3TKR3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlrp4cQ3TKR3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Nlrp4cQ3TKR3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nlrp4cQ3TKR3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlrp4cQ3TKR3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlrp4cQ3TKR3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlrp4cQ3TKR3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlrp4cQ3TKR3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlrp4cQ3TKR3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nlrp4cQ3TKR3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Nlrp4cQ3TKR3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms