Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIU4

Pde12, 2',5'-phosphodiesterase 12, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde12Q3TIU4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde12Q3TIU4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde12Q3TIU4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde12Q3TIU4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde12Q3TIU4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde12Q3TIU4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde12Q3TIU4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde12Q3TIU4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde12Q3TIU4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde12Q3TIU4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde12Q3TIU4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde12Q3TIU4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde12Q3TIU4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde12Q3TIU4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde12Q3TIU4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde12Q3TIU4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde12Q3TIU4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde12Q3TIU4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde12Q3TIU4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde12Q3TIU4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde12Q3TIU4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde12Q3TIU4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde12Q3TIU4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde12Q3TIU4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde12Q3TIU4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde12Q3TIU4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde12Q3TIU4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde12Q3TIU4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde12Q3TIU4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde12Q3TIU4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pde12Q3TIU4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pde12Q3TIU4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pde12Q3TIU4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pde12Q3TIU4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pde12Q3TIU4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde12Q3TIU4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde12Q3TIU4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde12Q3TIU4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde12Q3TIU4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde12Q3TIU4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde12Q3TIU4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde12Q3TIU4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde12Q3TIU4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pde12Q3TIU4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pde12Q3TIU4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pde12Q3TIU4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pde12Q3TIU4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pde12Q3TIU4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde12Q3TIU4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde12Q3TIU4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde12Q3TIU4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde12Q3TIU4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde12Q3TIU4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pde12Q3TIU4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pde12Q3TIU4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pde12Q3TIU4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Pde12Q3TIU4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pde12Q3TIU4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pde12Q3TIU4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pde12Q3TIU4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pde12Q3TIU4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pde12Q3TIU4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pde12Q3TIU4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pde12Q3TIU4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pde12Q3TIU4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pde12Q3TIU4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pde12Q3TIU4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pde12Q3TIU4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pde12Q3TIU4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pde12Q3TIU4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pde12Q3TIU4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pde12Q3TIU4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pde12Q3TIU4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pde12Q3TIU4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pde12Q3TIU4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pde12Q3TIU4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pde12Q3TIU4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pde12Q3TIU4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde12Q3TIU4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde12Q3TIU4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde12Q3TIU4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde12Q3TIU4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde12Q3TIU4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde12Q3TIU4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde12Q3TIU4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde12Q3TIU4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde12Q3TIU4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde12Q3TIU4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde12Q3TIU4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde12Q3TIU4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde12Q3TIU4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde12Q3TIU4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde12Q3TIU4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde12Q3TIU4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde12Q3TIU4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pde12Q3TIU4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pde12Q3TIU4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pde12Q3TIU4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pde12Q3TIU4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pde12Q3TIU4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms