Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Trpm1Q2TV84 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Trpm1Q2TV84 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Trpm1Q2TV84 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Trpm1Q2TV84 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Trpm1Q2TV84 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Trpm1Q2TV84 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Trpm1Q2TV84 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Trpm1Q2TV84 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Trpm1Q2TV84 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Trpm1Q2TV84 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
Trpm1Q2TV84 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Trpm1Q2TV84 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Trpm1Q2TV84 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Trpm1Q2TV84 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Trpm1Q2TV84 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Trpm1Q2TV84 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Trpm1Q2TV84 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Trpm1Q2TV84 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Trpm1Q2TV84 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Trpm1Q2TV84 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Trpm1Q2TV84 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Trpm1Q2TV84 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Trpm1Q2TV84 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Trpm1Q2TV84 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Trpm1Q2TV84 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Trpm1Q2TV84 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Trpm1Q2TV84 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Trpm1Q2TV84 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Trpm1Q2TV84 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Trpm1Q2TV84 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Trpm1Q2TV84 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Trpm1Q2TV84 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Trpm1Q2TV84 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Trpm1Q2TV84 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Trpm1Q2TV84 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Trpm1Q2TV84 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Trpm1Q2TV84 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Trpm1Q2TV84 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Trpm1Q2TV84 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Trpm1Q2TV84 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Trpm1Q2TV84 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Trpm1Q2TV84 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Trpm1Q2TV84 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Trpm1Q2TV84 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Trpm1Q2TV84 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Trpm1Q2TV84 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Trpm1Q2TV84 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Trpm1Q2TV84 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Trpm1Q2TV84 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Trpm1Q2TV84 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Trpm1Q2TV84 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Trpm1Q2TV84 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Trpm1Q2TV84 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Trpm1Q2TV84 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Trpm1Q2TV84 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Trpm1Q2TV84 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Trpm1Q2TV84 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Trpm1Q2TV84 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Trpm1Q2TV84 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Trpm1Q2TV84 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Trpm1Q2TV84 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Trpm1Q2TV84 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Trpm1Q2TV84 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Trpm1Q2TV84 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Trpm1Q2TV84 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Trpm1Q2TV84 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Trpm1Q2TV84 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Trpm1Q2TV84 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Trpm1Q2TV84 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Trpm1Q2TV84 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Trpm1Q2TV84 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Trpm1Q2TV84 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Trpm1Q2TV84 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Trpm1Q2TV84 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Trpm1Q2TV84 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Trpm1Q2TV84 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Trpm1Q2TV84 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Trpm1Q2TV84 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Trpm1Q2TV84 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Trpm1Q2TV84 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Trpm1Q2TV84 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Trpm1Q2TV84 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Trpm1Q2TV84 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Trpm1Q2TV84 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Trpm1Q2TV84 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Trpm1Q2TV84 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Trpm1Q2TV84 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Trpm1Q2TV84 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Trpm1Q2TV84 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Trpm1Q2TV84 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Trpm1Q2TV84 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Trpm1Q2TV84 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Trpm1Q2TV84 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Trpm1Q2TV84 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Trpm1Q2TV84 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Trpm1Q2TV84 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Trpm1Q2TV84 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Trpm1Q2TV84 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Trpm1Q2TV84 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms