Protein–RNA interactions for Protein: Q2QI47

Ush2A, Usherin, mousemouse

Predictions only

Length 5,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush2AQ2QI47 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,09□□□□□ -0,31
Ush2AQ2QI47 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC13,09□□□□□ -0,31
Ush2AQ2QI47 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC13,09□□□□□ -0,31
Ush2AQ2QI47 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC13,09□□□□□ -0,31
Ush2AQ2QI47 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,09□□□□□ -0,31
Ush2AQ2QI47 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,08□□□□□ -0,32
Ush2AQ2QI47 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC13,07□□□□□ -0,32
Ush2AQ2QI47 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC13,07□□□□□ -0,32
Ush2AQ2QI47 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13,07□□□□□ -0,32
Ush2AQ2QI47 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,06□□□□□ -0,32
Ush2AQ2QI47 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,06□□□□□ -0,32
Ush2AQ2QI47 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC13,06□□□□□ -0,32
Ush2AQ2QI47 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,06□□□□□ -0,32
Ush2AQ2QI47 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13,06□□□□□ -0,32
Ush2AQ2QI47 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC13,06□□□□□ -0,32
Ush2AQ2QI47 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13,06□□□□□ -0,32
Ush2AQ2QI47 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC13,05□□□□□ -0,32
Ush2AQ2QI47 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13,05□□□□□ -0,32
Ush2AQ2QI47 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,05□□□□□ -0,32
Ush2AQ2QI47 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC13,04□□□□□ -0,32
Ush2AQ2QI47 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,04□□□□□ -0,32
Ush2AQ2QI47 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,04□□□□□ -0,32
Ush2AQ2QI47 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13,04□□□□□ -0,32
Ush2AQ2QI47 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,03□□□□□ -0,32
Ush2AQ2QI47 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13,03□□□□□ -0,32
Ush2AQ2QI47 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,03□□□□□ -0,32
Ush2AQ2QI47 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,03□□□□□ -0,32
Ush2AQ2QI47 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13,03□□□□□ -0,32
Ush2AQ2QI47 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13,03□□□□□ -0,32
Ush2AQ2QI47 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13,03□□□□□ -0,32
Ush2AQ2QI47 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13,02□□□□□ -0,32
Ush2AQ2QI47 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC13,02□□□□□ -0,33
Ush2AQ2QI47 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,02□□□□□ -0,33
Ush2AQ2QI47 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC13,02□□□□□ -0,33
Ush2AQ2QI47 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13,02□□□□□ -0,33
Ush2AQ2QI47 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,02□□□□□ -0,33
Ush2AQ2QI47 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC13,02□□□□□ -0,33
Ush2AQ2QI47 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,02□□□□□ -0,33
Ush2AQ2QI47 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13,02□□□□□ -0,33
Ush2AQ2QI47 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13,01□□□□□ -0,33
Ush2AQ2QI47 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,01□□□□□ -0,33
Ush2AQ2QI47 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,01□□□□□ -0,33
Ush2AQ2QI47 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13,01□□□□□ -0,33
Ush2AQ2QI47 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC13,01□□□□□ -0,33
Ush2AQ2QI47 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13,01□□□□□ -0,33
Ush2AQ2QI47 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,01□□□□□ -0,33
Ush2AQ2QI47 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0,33
Ush2AQ2QI47 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0,33
Ush2AQ2QI47 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0,33
Ush2AQ2QI47 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC13□□□□□ -0,33
Ush2AQ2QI47 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0,33
Ush2AQ2QI47 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC12,99□□□□□ -0,33
Ush2AQ2QI47 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12,99□□□□□ -0,33
Ush2AQ2QI47 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC12,99□□□□□ -0,33
Ush2AQ2QI47 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC12,99□□□□□ -0,33
Ush2AQ2QI47 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC12,98□□□□□ -0,33
Ush2AQ2QI47 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC12,98□□□□□ -0,33
Ush2AQ2QI47 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12,98□□□□□ -0,33
Ush2AQ2QI47 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12,98□□□□□ -0,33
Ush2AQ2QI47 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12,97□□□□□ -0,33
Ush2AQ2QI47 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,97□□□□□ -0,33
Ush2AQ2QI47 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,97□□□□□ -0,33
Ush2AQ2QI47 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC12,96□□□□□ -0,33
Ush2AQ2QI47 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC12,96□□□□□ -0,33
Ush2AQ2QI47 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC12,96□□□□□ -0,34
Ush2AQ2QI47 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC12,96□□□□□ -0,34
Ush2AQ2QI47 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC12,95□□□□□ -0,34
Ush2AQ2QI47 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC12,95□□□□□ -0,34
Ush2AQ2QI47 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC12,95□□□□□ -0,34
Ush2AQ2QI47 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12,95□□□□□ -0,34
Ush2AQ2QI47 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC12,95□□□□□ -0,34
Ush2AQ2QI47 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC12,95□□□□□ -0,34
Ush2AQ2QI47 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,95□□□□□ -0,34
Ush2AQ2QI47 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12,94□□□□□ -0,34
Ush2AQ2QI47 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC12,94□□□□□ -0,34
Ush2AQ2QI47 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC12,94□□□□□ -0,34
Ush2AQ2QI47 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC12,94□□□□□ -0,34
Ush2AQ2QI47 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,94□□□□□ -0,34
Ush2AQ2QI47 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC12,94□□□□□ -0,34
Ush2AQ2QI47 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,94□□□□□ -0,34
Ush2AQ2QI47 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC12,94□□□□□ -0,34
Ush2AQ2QI47 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,94□□□□□ -0,34
Ush2AQ2QI47 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC12,93□□□□□ -0,34
Ush2AQ2QI47 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC12,93□□□□□ -0,34
Ush2AQ2QI47 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12,93□□□□□ -0,34
Ush2AQ2QI47 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC12,92□□□□□ -0,34
Ush2AQ2QI47 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC12,92□□□□□ -0,34
Ush2AQ2QI47 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC12,92□□□□□ -0,34
Ush2AQ2QI47 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,92□□□□□ -0,34
Ush2AQ2QI47 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12,92□□□□□ -0,34
Ush2AQ2QI47 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC12,92□□□□□ -0,34
Ush2AQ2QI47 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC12,92□□□□□ -0,34
Ush2AQ2QI47 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12,92□□□□□ -0,34
Ush2AQ2QI47 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC12,92□□□□□ -0,34
Ush2AQ2QI47 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,91□□□□□ -0,34
Ush2AQ2QI47 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12,91□□□□□ -0,34
Ush2AQ2QI47 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,91□□□□□ -0,34
Ush2AQ2QI47 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12,91□□□□□ -0,34
Ush2AQ2QI47 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,91□□□□□ -0,34
Ush2AQ2QI47 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC12,91□□□□□ -0,34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,8 ms