Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Samd11Q1RNF8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Samd11Q1RNF8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Samd11Q1RNF8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Samd11Q1RNF8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Samd11Q1RNF8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Samd11Q1RNF8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Samd11Q1RNF8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Samd11Q1RNF8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Samd11Q1RNF8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Samd11Q1RNF8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Samd11Q1RNF8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Samd11Q1RNF8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Samd11Q1RNF8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Samd11Q1RNF8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Samd11Q1RNF8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Samd11Q1RNF8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Samd11Q1RNF8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Samd11Q1RNF8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Samd11Q1RNF8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Samd11Q1RNF8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Samd11Q1RNF8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Samd11Q1RNF8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Samd11Q1RNF8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Samd11Q1RNF8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Samd11Q1RNF8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Samd11Q1RNF8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Samd11Q1RNF8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Samd11Q1RNF8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Samd11Q1RNF8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Samd11Q1RNF8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Samd11Q1RNF8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Samd11Q1RNF8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Samd11Q1RNF8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Samd11Q1RNF8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Samd11Q1RNF8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Samd11Q1RNF8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Samd11Q1RNF8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Samd11Q1RNF8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Samd11Q1RNF8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Samd11Q1RNF8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Samd11Q1RNF8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Samd11Q1RNF8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Samd11Q1RNF8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Samd11Q1RNF8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Samd11Q1RNF8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Samd11Q1RNF8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Samd11Q1RNF8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Samd11Q1RNF8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Samd11Q1RNF8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Samd11Q1RNF8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Samd11Q1RNF8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Samd11Q1RNF8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Samd11Q1RNF8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Samd11Q1RNF8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Samd11Q1RNF8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Samd11Q1RNF8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Samd11Q1RNF8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Samd11Q1RNF8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Samd11Q1RNF8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Samd11Q1RNF8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Samd11Q1RNF8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Samd11Q1RNF8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Samd11Q1RNF8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Samd11Q1RNF8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Samd11Q1RNF8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Samd11Q1RNF8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Samd11Q1RNF8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Samd11Q1RNF8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Samd11Q1RNF8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Samd11Q1RNF8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Samd11Q1RNF8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Samd11Q1RNF8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Samd11Q1RNF8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Samd11Q1RNF8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Samd11Q1RNF8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Samd11Q1RNF8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Samd11Q1RNF8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Samd11Q1RNF8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Samd11Q1RNF8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Samd11Q1RNF8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Samd11Q1RNF8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Samd11Q1RNF8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Samd11Q1RNF8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Samd11Q1RNF8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Samd11Q1RNF8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Samd11Q1RNF8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Samd11Q1RNF8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Samd11Q1RNF8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Samd11Q1RNF8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Samd11Q1RNF8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Samd11Q1RNF8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Samd11Q1RNF8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Samd11Q1RNF8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Samd11Q1RNF8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Samd11Q1RNF8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Samd11Q1RNF8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Samd11Q1RNF8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Samd11Q1RNF8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Samd11Q1RNF8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms