Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V9

Slc45a4, Solute carrier family 45 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc45a4Q0P5V9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc45a4Q0P5V9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc45a4Q0P5V9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc45a4Q0P5V9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc45a4Q0P5V9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Slc45a4Q0P5V9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Slc45a4Q0P5V9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc45a4Q0P5V9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc45a4Q0P5V9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc45a4Q0P5V9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc45a4Q0P5V9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc45a4Q0P5V9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc45a4Q0P5V9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc45a4Q0P5V9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc45a4Q0P5V9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc45a4Q0P5V9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc45a4Q0P5V9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc45a4Q0P5V9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc45a4Q0P5V9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc45a4Q0P5V9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc45a4Q0P5V9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc45a4Q0P5V9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc45a4Q0P5V9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc45a4Q0P5V9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc45a4Q0P5V9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc45a4Q0P5V9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc45a4Q0P5V9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Slc45a4Q0P5V9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc45a4Q0P5V9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc45a4Q0P5V9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc45a4Q0P5V9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc45a4Q0P5V9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc45a4Q0P5V9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc45a4Q0P5V9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc45a4Q0P5V9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc45a4Q0P5V9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc45a4Q0P5V9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc45a4Q0P5V9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc45a4Q0P5V9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc45a4Q0P5V9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc45a4Q0P5V9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc45a4Q0P5V9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc45a4Q0P5V9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc45a4Q0P5V9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc45a4Q0P5V9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc45a4Q0P5V9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc45a4Q0P5V9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc45a4Q0P5V9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc45a4Q0P5V9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc45a4Q0P5V9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc45a4Q0P5V9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc45a4Q0P5V9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc45a4Q0P5V9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc45a4Q0P5V9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc45a4Q0P5V9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc45a4Q0P5V9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc45a4Q0P5V9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc45a4Q0P5V9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc45a4Q0P5V9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc45a4Q0P5V9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc45a4Q0P5V9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc45a4Q0P5V9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc45a4Q0P5V9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc45a4Q0P5V9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc45a4Q0P5V9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc45a4Q0P5V9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc45a4Q0P5V9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc45a4Q0P5V9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc45a4Q0P5V9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc45a4Q0P5V9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc45a4Q0P5V9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc45a4Q0P5V9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc45a4Q0P5V9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc45a4Q0P5V9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc45a4Q0P5V9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc45a4Q0P5V9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc45a4Q0P5V9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc45a4Q0P5V9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc45a4Q0P5V9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc45a4Q0P5V9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc45a4Q0P5V9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc45a4Q0P5V9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc45a4Q0P5V9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc45a4Q0P5V9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc45a4Q0P5V9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc45a4Q0P5V9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc45a4Q0P5V9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc45a4Q0P5V9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc45a4Q0P5V9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc45a4Q0P5V9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc45a4Q0P5V9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc45a4Q0P5V9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc45a4Q0P5V9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc45a4Q0P5V9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc45a4Q0P5V9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc45a4Q0P5V9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc45a4Q0P5V9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc45a4Q0P5V9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc45a4Q0P5V9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc45a4Q0P5V9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms