Protein–RNA interactions for Protein: Q0P523

Cib3, Calcium and integrin-binding family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib3Q0P523 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cib3Q0P523 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cib3Q0P523 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cib3Q0P523 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cib3Q0P523 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cib3Q0P523 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cib3Q0P523 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cib3Q0P523 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cib3Q0P523 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cib3Q0P523 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cib3Q0P523 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cib3Q0P523 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cib3Q0P523 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cib3Q0P523 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cib3Q0P523 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cib3Q0P523 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cib3Q0P523 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cib3Q0P523 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cib3Q0P523 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cib3Q0P523 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cib3Q0P523 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cib3Q0P523 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cib3Q0P523 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cib3Q0P523 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cib3Q0P523 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cib3Q0P523 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cib3Q0P523 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cib3Q0P523 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cib3Q0P523 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cib3Q0P523 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cib3Q0P523 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cib3Q0P523 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cib3Q0P523 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cib3Q0P523 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cib3Q0P523 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cib3Q0P523 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cib3Q0P523 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cib3Q0P523 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cib3Q0P523 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cib3Q0P523 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cib3Q0P523 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cib3Q0P523 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cib3Q0P523 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cib3Q0P523 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cib3Q0P523 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cib3Q0P523 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cib3Q0P523 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cib3Q0P523 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cib3Q0P523 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cib3Q0P523 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cib3Q0P523 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cib3Q0P523 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cib3Q0P523 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cib3Q0P523 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cib3Q0P523 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cib3Q0P523 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cib3Q0P523 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cib3Q0P523 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cib3Q0P523 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cib3Q0P523 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cib3Q0P523 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cib3Q0P523 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cib3Q0P523 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cib3Q0P523 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cib3Q0P523 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cib3Q0P523 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cib3Q0P523 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cib3Q0P523 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cib3Q0P523 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cib3Q0P523 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cib3Q0P523 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cib3Q0P523 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cib3Q0P523 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cib3Q0P523 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cib3Q0P523 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cib3Q0P523 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cib3Q0P523 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cib3Q0P523 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cib3Q0P523 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cib3Q0P523 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cib3Q0P523 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cib3Q0P523 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cib3Q0P523 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cib3Q0P523 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cib3Q0P523 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cib3Q0P523 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cib3Q0P523 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cib3Q0P523 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cib3Q0P523 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cib3Q0P523 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cib3Q0P523 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cib3Q0P523 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cib3Q0P523 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cib3Q0P523 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cib3Q0P523 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cib3Q0P523 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cib3Q0P523 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cib3Q0P523 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cib3Q0P523 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cib3Q0P523 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms