Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cnnm1Q0GA42 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cnnm1Q0GA42 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cnnm1Q0GA42 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cnnm1Q0GA42 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cnnm1Q0GA42 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cnnm1Q0GA42 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cnnm1Q0GA42 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cnnm1Q0GA42 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cnnm1Q0GA42 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cnnm1Q0GA42 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cnnm1Q0GA42 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Cnnm1Q0GA42 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Cnnm1Q0GA42 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cnnm1Q0GA42 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cnnm1Q0GA42 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cnnm1Q0GA42 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cnnm1Q0GA42 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cnnm1Q0GA42 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cnnm1Q0GA42 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cnnm1Q0GA42 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cnnm1Q0GA42 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cnnm1Q0GA42 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cnnm1Q0GA42 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cnnm1Q0GA42 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cnnm1Q0GA42 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cnnm1Q0GA42 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cnnm1Q0GA42 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cnnm1Q0GA42 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cnnm1Q0GA42 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Cnnm1Q0GA42 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cnnm1Q0GA42 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cnnm1Q0GA42 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Cnnm1Q0GA42 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cnnm1Q0GA42 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cnnm1Q0GA42 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cnnm1Q0GA42 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cnnm1Q0GA42 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cnnm1Q0GA42 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cnnm1Q0GA42 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cnnm1Q0GA42 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cnnm1Q0GA42 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cnnm1Q0GA42 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cnnm1Q0GA42 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cnnm1Q0GA42 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cnnm1Q0GA42 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cnnm1Q0GA42 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cnnm1Q0GA42 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cnnm1Q0GA42 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cnnm1Q0GA42 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cnnm1Q0GA42 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cnnm1Q0GA42 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cnnm1Q0GA42 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cnnm1Q0GA42 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cnnm1Q0GA42 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cnnm1Q0GA42 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cnnm1Q0GA42 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cnnm1Q0GA42 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cnnm1Q0GA42 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cnnm1Q0GA42 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cnnm1Q0GA42 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cnnm1Q0GA42 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cnnm1Q0GA42 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cnnm1Q0GA42 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cnnm1Q0GA42 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cnnm1Q0GA42 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cnnm1Q0GA42 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cnnm1Q0GA42 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cnnm1Q0GA42 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cnnm1Q0GA42 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cnnm1Q0GA42 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cnnm1Q0GA42 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cnnm1Q0GA42 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cnnm1Q0GA42 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cnnm1Q0GA42 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Cnnm1Q0GA42 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cnnm1Q0GA42 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cnnm1Q0GA42 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cnnm1Q0GA42 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cnnm1Q0GA42 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cnnm1Q0GA42 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cnnm1Q0GA42 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cnnm1Q0GA42 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cnnm1Q0GA42 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cnnm1Q0GA42 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cnnm1Q0GA42 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cnnm1Q0GA42 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cnnm1Q0GA42 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cnnm1Q0GA42 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cnnm1Q0GA42 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cnnm1Q0GA42 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cnnm1Q0GA42 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cnnm1Q0GA42 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cnnm1Q0GA42 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cnnm1Q0GA42 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Cnnm1Q0GA42 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cnnm1Q0GA42 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cnnm1Q0GA42 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cnnm1Q0GA42 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cnnm1Q0GA42 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms