Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ebf1Q07802 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ebf1Q07802 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ebf1Q07802 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ebf1Q07802 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ebf1Q07802 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ebf1Q07802 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ebf1Q07802 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ebf1Q07802 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ebf1Q07802 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ebf1Q07802 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ebf1Q07802 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ebf1Q07802 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ebf1Q07802 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ebf1Q07802 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ebf1Q07802 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ebf1Q07802 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ebf1Q07802 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ebf1Q07802 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ebf1Q07802 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ebf1Q07802 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ebf1Q07802 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ebf1Q07802 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ebf1Q07802 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ebf1Q07802 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ebf1Q07802 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ebf1Q07802 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ebf1Q07802 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ebf1Q07802 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ebf1Q07802 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ebf1Q07802 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ebf1Q07802 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ebf1Q07802 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ebf1Q07802 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ebf1Q07802 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ebf1Q07802 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ebf1Q07802 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ebf1Q07802 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ebf1Q07802 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ebf1Q07802 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ebf1Q07802 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ebf1Q07802 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ebf1Q07802 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ebf1Q07802 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ebf1Q07802 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ebf1Q07802 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ebf1Q07802 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ebf1Q07802 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ebf1Q07802 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ebf1Q07802 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ebf1Q07802 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ebf1Q07802 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ebf1Q07802 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ebf1Q07802 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ebf1Q07802 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ebf1Q07802 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ebf1Q07802 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ebf1Q07802 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ebf1Q07802 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ebf1Q07802 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ebf1Q07802 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ebf1Q07802 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ebf1Q07802 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ebf1Q07802 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ebf1Q07802 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ebf1Q07802 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ebf1Q07802 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ebf1Q07802 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ebf1Q07802 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ebf1Q07802 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ebf1Q07802 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ebf1Q07802 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ebf1Q07802 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ebf1Q07802 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ebf1Q07802 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ebf1Q07802 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ebf1Q07802 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ebf1Q07802 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ebf1Q07802 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ebf1Q07802 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ebf1Q07802 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ebf1Q07802 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ebf1Q07802 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ebf1Q07802 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ebf1Q07802 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ebf1Q07802 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ebf1Q07802 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ebf1Q07802 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ebf1Q07802 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ebf1Q07802 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ebf1Q07802 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ebf1Q07802 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ebf1Q07802 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ebf1Q07802 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ebf1Q07802 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ebf1Q07802 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ebf1Q07802 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ebf1Q07802 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ebf1Q07802 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ebf1Q07802 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms