Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nfe2Q07279 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nfe2Q07279 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nfe2Q07279 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nfe2Q07279 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nfe2Q07279 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nfe2Q07279 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nfe2Q07279 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nfe2Q07279 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nfe2Q07279 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nfe2Q07279 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nfe2Q07279 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nfe2Q07279 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Nfe2Q07279 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nfe2Q07279 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nfe2Q07279 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nfe2Q07279 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nfe2Q07279 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nfe2Q07279 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nfe2Q07279 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Nfe2Q07279 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nfe2Q07279 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nfe2Q07279 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nfe2Q07279 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nfe2Q07279 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nfe2Q07279 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nfe2Q07279 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nfe2Q07279 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nfe2Q07279 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Nfe2Q07279 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nfe2Q07279 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nfe2Q07279 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nfe2Q07279 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nfe2Q07279 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nfe2Q07279 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nfe2Q07279 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nfe2Q07279 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nfe2Q07279 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Nfe2Q07279 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nfe2Q07279 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nfe2Q07279 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nfe2Q07279 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nfe2Q07279 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Nfe2Q07279 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nfe2Q07279 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nfe2Q07279 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nfe2Q07279 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nfe2Q07279 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nfe2Q07279 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nfe2Q07279 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nfe2Q07279 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Nfe2Q07279 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nfe2Q07279 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nfe2Q07279 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nfe2Q07279 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Nfe2Q07279 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nfe2Q07279 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nfe2Q07279 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nfe2Q07279 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nfe2Q07279 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nfe2Q07279 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nfe2Q07279 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nfe2Q07279 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nfe2Q07279 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nfe2Q07279 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nfe2Q07279 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nfe2Q07279 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nfe2Q07279 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nfe2Q07279 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nfe2Q07279 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nfe2Q07279 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nfe2Q07279 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nfe2Q07279 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nfe2Q07279 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nfe2Q07279 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nfe2Q07279 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nfe2Q07279 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nfe2Q07279 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nfe2Q07279 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nfe2Q07279 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nfe2Q07279 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nfe2Q07279 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nfe2Q07279 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nfe2Q07279 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Nfe2Q07279 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nfe2Q07279 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nfe2Q07279 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nfe2Q07279 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nfe2Q07279 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nfe2Q07279 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nfe2Q07279 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Nfe2Q07279 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nfe2Q07279 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nfe2Q07279 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nfe2Q07279 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nfe2Q07279 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nfe2Q07279 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nfe2Q07279 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nfe2Q07279 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nfe2Q07279 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms