Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Siah1bQ06985 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Siah1bQ06985 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Siah1bQ06985 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Siah1bQ06985 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Siah1bQ06985 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Siah1bQ06985 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Siah1bQ06985 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Siah1bQ06985 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Siah1bQ06985 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Siah1bQ06985 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Siah1bQ06985 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Siah1bQ06985 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Siah1bQ06985 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Siah1bQ06985 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Siah1bQ06985 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Siah1bQ06985 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Siah1bQ06985 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Siah1bQ06985 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Siah1bQ06985 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Siah1bQ06985 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Siah1bQ06985 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Siah1bQ06985 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Siah1bQ06985 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Siah1bQ06985 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Siah1bQ06985 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Siah1bQ06985 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Siah1bQ06985 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Siah1bQ06985 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Siah1bQ06985 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Siah1bQ06985 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Siah1bQ06985 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Siah1bQ06985 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Siah1bQ06985 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Siah1bQ06985 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Siah1bQ06985 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Siah1bQ06985 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Siah1bQ06985 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Siah1bQ06985 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Siah1bQ06985 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Siah1bQ06985 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Siah1bQ06985 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Siah1bQ06985 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Siah1bQ06985 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Siah1bQ06985 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Siah1bQ06985 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Siah1bQ06985 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Siah1bQ06985 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Siah1bQ06985 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Siah1bQ06985 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Siah1bQ06985 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Siah1bQ06985 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Siah1bQ06985 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Siah1bQ06985 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Siah1bQ06985 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Siah1bQ06985 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Siah1bQ06985 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Siah1bQ06985 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Siah1bQ06985 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Siah1bQ06985 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Siah1bQ06985 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Siah1bQ06985 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Siah1bQ06985 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Siah1bQ06985 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Siah1bQ06985 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Siah1bQ06985 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Siah1bQ06985 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Siah1bQ06985 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Siah1bQ06985 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Siah1bQ06985 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Siah1bQ06985 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Siah1bQ06985 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Siah1bQ06985 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Siah1bQ06985 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Siah1bQ06985 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Siah1bQ06985 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Siah1bQ06985 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Siah1bQ06985 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Siah1bQ06985 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Siah1bQ06985 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Siah1bQ06985 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Siah1bQ06985 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Siah1bQ06985 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Siah1bQ06985 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Siah1bQ06985 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Siah1bQ06985 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Siah1bQ06985 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Siah1bQ06985 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Siah1bQ06985 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Siah1bQ06985 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Siah1bQ06985 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Siah1bQ06985 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Siah1bQ06985 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Siah1bQ06985 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Siah1bQ06985 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Siah1bQ06985 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Siah1bQ06985 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Siah1bQ06985 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Siah1bQ06985 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Siah1bQ06985 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms