Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sh3bp2Q06649 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sh3bp2Q06649 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sh3bp2Q06649 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sh3bp2Q06649 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Sh3bp2Q06649 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sh3bp2Q06649 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sh3bp2Q06649 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sh3bp2Q06649 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sh3bp2Q06649 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sh3bp2Q06649 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sh3bp2Q06649 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sh3bp2Q06649 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sh3bp2Q06649 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sh3bp2Q06649 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sh3bp2Q06649 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sh3bp2Q06649 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sh3bp2Q06649 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Sh3bp2Q06649 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Sh3bp2Q06649 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sh3bp2Q06649 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sh3bp2Q06649 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sh3bp2Q06649 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sh3bp2Q06649 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Sh3bp2Q06649 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sh3bp2Q06649 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sh3bp2Q06649 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sh3bp2Q06649 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sh3bp2Q06649 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sh3bp2Q06649 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3bp2Q06649 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3bp2Q06649 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3bp2Q06649 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3bp2Q06649 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3bp2Q06649 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3bp2Q06649 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3bp2Q06649 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3bp2Q06649 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3bp2Q06649 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3bp2Q06649 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3bp2Q06649 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3bp2Q06649 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3bp2Q06649 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3bp2Q06649 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3bp2Q06649 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3bp2Q06649 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3bp2Q06649 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3bp2Q06649 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3bp2Q06649 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3bp2Q06649 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3bp2Q06649 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3bp2Q06649 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sh3bp2Q06649 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sh3bp2Q06649 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sh3bp2Q06649 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sh3bp2Q06649 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sh3bp2Q06649 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3bp2Q06649 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3bp2Q06649 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3bp2Q06649 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3bp2Q06649 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3bp2Q06649 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3bp2Q06649 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3bp2Q06649 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3bp2Q06649 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3bp2Q06649 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3bp2Q06649 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3bp2Q06649 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3bp2Q06649 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3bp2Q06649 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3bp2Q06649 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sh3bp2Q06649 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh3bp2Q06649 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh3bp2Q06649 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh3bp2Q06649 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh3bp2Q06649 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sh3bp2Q06649 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh3bp2Q06649 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh3bp2Q06649 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh3bp2Q06649 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh3bp2Q06649 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh3bp2Q06649 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh3bp2Q06649 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh3bp2Q06649 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh3bp2Q06649 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh3bp2Q06649 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh3bp2Q06649 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh3bp2Q06649 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh3bp2Q06649 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh3bp2Q06649 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh3bp2Q06649 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sh3bp2Q06649 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sh3bp2Q06649 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sh3bp2Q06649 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sh3bp2Q06649 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sh3bp2Q06649 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3bp2Q06649 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3bp2Q06649 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3bp2Q06649 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh3bp2Q06649 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms