Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col9a1Q05722 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col9a1Q05722 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col9a1Q05722 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col9a1Q05722 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col9a1Q05722 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Col9a1Q05722 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col9a1Q05722 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Col9a1Q05722 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Col9a1Q05722 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col9a1Q05722 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col9a1Q05722 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col9a1Q05722 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col9a1Q05722 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Col9a1Q05722 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Col9a1Q05722 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col9a1Q05722 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col9a1Q05722 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col9a1Q05722 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col9a1Q05722 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col9a1Q05722 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col9a1Q05722 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col9a1Q05722 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col9a1Q05722 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col9a1Q05722 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col9a1Q05722 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Col9a1Q05722 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col9a1Q05722 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col9a1Q05722 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col9a1Q05722 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Col9a1Q05722 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col9a1Q05722 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col9a1Q05722 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col9a1Q05722 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col9a1Q05722 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col9a1Q05722 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Col9a1Q05722 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col9a1Q05722 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col9a1Q05722 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col9a1Q05722 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Col9a1Q05722 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col9a1Q05722 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col9a1Q05722 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col9a1Q05722 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col9a1Q05722 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col9a1Q05722 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Col9a1Q05722 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Col9a1Q05722 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col9a1Q05722 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Col9a1Q05722 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col9a1Q05722 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col9a1Q05722 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col9a1Q05722 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col9a1Q05722 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col9a1Q05722 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col9a1Q05722 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col9a1Q05722 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col9a1Q05722 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col9a1Q05722 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col9a1Q05722 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col9a1Q05722 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col9a1Q05722 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col9a1Q05722 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col9a1Q05722 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col9a1Q05722 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col9a1Q05722 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col9a1Q05722 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col9a1Q05722 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col9a1Q05722 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col9a1Q05722 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col9a1Q05722 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col9a1Q05722 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col9a1Q05722 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col9a1Q05722 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Col9a1Q05722 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col9a1Q05722 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Col9a1Q05722 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col9a1Q05722 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col9a1Q05722 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col9a1Q05722 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col9a1Q05722 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col9a1Q05722 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col9a1Q05722 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Col9a1Q05722 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col9a1Q05722 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col9a1Q05722 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col9a1Q05722 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col9a1Q05722 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col9a1Q05722 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col9a1Q05722 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col9a1Q05722 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col9a1Q05722 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col9a1Q05722 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col9a1Q05722 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col9a1Q05722 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col9a1Q05722 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col9a1Q05722 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col9a1Q05722 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col9a1Q05722 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col9a1Q05722 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms