Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sox10Q04888 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sox10Q04888 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sox10Q04888 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sox10Q04888 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sox10Q04888 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sox10Q04888 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Sox10Q04888 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Sox10Q04888 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sox10Q04888 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sox10Q04888 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sox10Q04888 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sox10Q04888 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sox10Q04888 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sox10Q04888 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sox10Q04888 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sox10Q04888 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sox10Q04888 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Sox10Q04888 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sox10Q04888 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sox10Q04888 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Sox10Q04888 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sox10Q04888 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sox10Q04888 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sox10Q04888 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sox10Q04888 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sox10Q04888 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sox10Q04888 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sox10Q04888 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sox10Q04888 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sox10Q04888 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sox10Q04888 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sox10Q04888 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sox10Q04888 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sox10Q04888 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sox10Q04888 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sox10Q04888 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sox10Q04888 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sox10Q04888 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sox10Q04888 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sox10Q04888 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sox10Q04888 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sox10Q04888 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sox10Q04888 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sox10Q04888 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sox10Q04888 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Sox10Q04888 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sox10Q04888 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sox10Q04888 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sox10Q04888 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sox10Q04888 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sox10Q04888 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sox10Q04888 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sox10Q04888 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Sox10Q04888 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Sox10Q04888 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sox10Q04888 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sox10Q04888 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Sox10Q04888 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Sox10Q04888 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sox10Q04888 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sox10Q04888 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sox10Q04888 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sox10Q04888 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sox10Q04888 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sox10Q04888 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sox10Q04888 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sox10Q04888 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sox10Q04888 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sox10Q04888 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sox10Q04888 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sox10Q04888 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sox10Q04888 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sox10Q04888 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sox10Q04888 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sox10Q04888 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sox10Q04888 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sox10Q04888 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sox10Q04888 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sox10Q04888 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sox10Q04888 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sox10Q04888 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sox10Q04888 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sox10Q04888 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sox10Q04888 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sox10Q04888 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sox10Q04888 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sox10Q04888 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sox10Q04888 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sox10Q04888 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sox10Q04888 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sox10Q04888 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sox10Q04888 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sox10Q04888 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sox10Q04888 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sox10Q04888 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sox10Q04888 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sox10Q04888 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sox10Q04888 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sox10Q04888 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms