Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smpd1Q04519 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Smpd1Q04519 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smpd1Q04519 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smpd1Q04519 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smpd1Q04519 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smpd1Q04519 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smpd1Q04519 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smpd1Q04519 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smpd1Q04519 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smpd1Q04519 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Smpd1Q04519 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smpd1Q04519 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smpd1Q04519 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smpd1Q04519 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smpd1Q04519 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smpd1Q04519 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smpd1Q04519 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smpd1Q04519 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smpd1Q04519 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smpd1Q04519 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smpd1Q04519 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smpd1Q04519 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smpd1Q04519 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smpd1Q04519 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smpd1Q04519 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Smpd1Q04519 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Smpd1Q04519 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smpd1Q04519 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smpd1Q04519 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smpd1Q04519 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smpd1Q04519 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smpd1Q04519 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smpd1Q04519 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smpd1Q04519 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smpd1Q04519 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smpd1Q04519 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smpd1Q04519 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Smpd1Q04519 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smpd1Q04519 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smpd1Q04519 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smpd1Q04519 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smpd1Q04519 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smpd1Q04519 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smpd1Q04519 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smpd1Q04519 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Smpd1Q04519 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smpd1Q04519 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smpd1Q04519 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smpd1Q04519 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smpd1Q04519 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smpd1Q04519 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smpd1Q04519 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smpd1Q04519 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smpd1Q04519 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smpd1Q04519 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smpd1Q04519 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smpd1Q04519 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smpd1Q04519 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smpd1Q04519 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smpd1Q04519 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smpd1Q04519 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smpd1Q04519 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smpd1Q04519 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smpd1Q04519 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smpd1Q04519 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smpd1Q04519 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smpd1Q04519 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smpd1Q04519 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smpd1Q04519 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smpd1Q04519 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smpd1Q04519 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smpd1Q04519 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smpd1Q04519 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Smpd1Q04519 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smpd1Q04519 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smpd1Q04519 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smpd1Q04519 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smpd1Q04519 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smpd1Q04519 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smpd1Q04519 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smpd1Q04519 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smpd1Q04519 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smpd1Q04519 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smpd1Q04519 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smpd1Q04519 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Smpd1Q04519 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smpd1Q04519 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smpd1Q04519 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smpd1Q04519 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smpd1Q04519 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smpd1Q04519 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smpd1Q04519 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smpd1Q04519 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smpd1Q04519 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smpd1Q04519 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smpd1Q04519 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smpd1Q04519 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smpd1Q04519 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smpd1Q04519 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.2 ms