Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tff2Q03404 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tff2Q03404 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tff2Q03404 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tff2Q03404 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tff2Q03404 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tff2Q03404 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tff2Q03404 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tff2Q03404 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tff2Q03404 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tff2Q03404 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tff2Q03404 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tff2Q03404 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tff2Q03404 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tff2Q03404 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tff2Q03404 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tff2Q03404 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tff2Q03404 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tff2Q03404 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tff2Q03404 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Tff2Q03404 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tff2Q03404 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tff2Q03404 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tff2Q03404 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tff2Q03404 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tff2Q03404 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tff2Q03404 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tff2Q03404 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tff2Q03404 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tff2Q03404 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tff2Q03404 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tff2Q03404 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tff2Q03404 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Tff2Q03404 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tff2Q03404 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tff2Q03404 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tff2Q03404 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tff2Q03404 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tff2Q03404 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tff2Q03404 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tff2Q03404 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tff2Q03404 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tff2Q03404 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tff2Q03404 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tff2Q03404 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tff2Q03404 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Tff2Q03404 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tff2Q03404 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tff2Q03404 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tff2Q03404 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tff2Q03404 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tff2Q03404 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tff2Q03404 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Tff2Q03404 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tff2Q03404 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tff2Q03404 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tff2Q03404 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tff2Q03404 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Tff2Q03404 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tff2Q03404 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Tff2Q03404 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tff2Q03404 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Tff2Q03404 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tff2Q03404 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tff2Q03404 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tff2Q03404 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tff2Q03404 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tff2Q03404 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tff2Q03404 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tff2Q03404 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tff2Q03404 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tff2Q03404 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tff2Q03404 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tff2Q03404 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tff2Q03404 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tff2Q03404 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Tff2Q03404 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tff2Q03404 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tff2Q03404 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tff2Q03404 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tff2Q03404 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tff2Q03404 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tff2Q03404 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tff2Q03404 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tff2Q03404 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tff2Q03404 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tff2Q03404 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tff2Q03404 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tff2Q03404 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tff2Q03404 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Tff2Q03404 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Tff2Q03404 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tff2Q03404 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tff2Q03404 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tff2Q03404 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tff2Q03404 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tff2Q03404 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tff2Q03404 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tff2Q03404 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Tff2Q03404 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms