Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Thbs2Q03350 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Thbs2Q03350 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Thbs2Q03350 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Thbs2Q03350 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Thbs2Q03350 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Thbs2Q03350 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Thbs2Q03350 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Thbs2Q03350 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Thbs2Q03350 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Thbs2Q03350 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Thbs2Q03350 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Thbs2Q03350 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Thbs2Q03350 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Thbs2Q03350 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Thbs2Q03350 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Thbs2Q03350 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Thbs2Q03350 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Thbs2Q03350 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Thbs2Q03350 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Thbs2Q03350 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Thbs2Q03350 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Thbs2Q03350 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Thbs2Q03350 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Thbs2Q03350 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Thbs2Q03350 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Thbs2Q03350 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Thbs2Q03350 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Thbs2Q03350 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Thbs2Q03350 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Thbs2Q03350 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Thbs2Q03350 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Thbs2Q03350 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Thbs2Q03350 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Thbs2Q03350 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Thbs2Q03350 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Thbs2Q03350 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Thbs2Q03350 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Thbs2Q03350 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Thbs2Q03350 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Thbs2Q03350 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Thbs2Q03350 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Thbs2Q03350 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Thbs2Q03350 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Thbs2Q03350 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Thbs2Q03350 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Thbs2Q03350 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Thbs2Q03350 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Thbs2Q03350 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Thbs2Q03350 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Thbs2Q03350 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Thbs2Q03350 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Thbs2Q03350 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Thbs2Q03350 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Thbs2Q03350 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Thbs2Q03350 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Thbs2Q03350 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Thbs2Q03350 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Thbs2Q03350 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Thbs2Q03350 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Thbs2Q03350 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Thbs2Q03350 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Thbs2Q03350 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Thbs2Q03350 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Thbs2Q03350 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Thbs2Q03350 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Thbs2Q03350 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Thbs2Q03350 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Thbs2Q03350 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Thbs2Q03350 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Thbs2Q03350 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Thbs2Q03350 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Thbs2Q03350 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Thbs2Q03350 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Thbs2Q03350 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Thbs2Q03350 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Thbs2Q03350 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Thbs2Q03350 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Thbs2Q03350 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Thbs2Q03350 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Thbs2Q03350 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Thbs2Q03350 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Thbs2Q03350 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Thbs2Q03350 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Thbs2Q03350 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Thbs2Q03350 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Thbs2Q03350 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Thbs2Q03350 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Thbs2Q03350 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Thbs2Q03350 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Thbs2Q03350 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Thbs2Q03350 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Thbs2Q03350 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Thbs2Q03350 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Thbs2Q03350 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Thbs2Q03350 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Thbs2Q03350 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Thbs2Q03350 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Thbs2Q03350 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Thbs2Q03350 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms