Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nhlh1Q02576 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nhlh1Q02576 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nhlh1Q02576 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nhlh1Q02576 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nhlh1Q02576 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nhlh1Q02576 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Nhlh1Q02576 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nhlh1Q02576 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nhlh1Q02576 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nhlh1Q02576 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nhlh1Q02576 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nhlh1Q02576 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nhlh1Q02576 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nhlh1Q02576 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nhlh1Q02576 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nhlh1Q02576 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nhlh1Q02576 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nhlh1Q02576 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Nhlh1Q02576 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nhlh1Q02576 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nhlh1Q02576 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nhlh1Q02576 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nhlh1Q02576 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nhlh1Q02576 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nhlh1Q02576 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nhlh1Q02576 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nhlh1Q02576 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Nhlh1Q02576 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nhlh1Q02576 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nhlh1Q02576 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Nhlh1Q02576 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nhlh1Q02576 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nhlh1Q02576 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nhlh1Q02576 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nhlh1Q02576 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Nhlh1Q02576 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nhlh1Q02576 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nhlh1Q02576 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nhlh1Q02576 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nhlh1Q02576 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nhlh1Q02576 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nhlh1Q02576 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nhlh1Q02576 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nhlh1Q02576 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nhlh1Q02576 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nhlh1Q02576 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nhlh1Q02576 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nhlh1Q02576 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nhlh1Q02576 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nhlh1Q02576 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nhlh1Q02576 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Nhlh1Q02576 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nhlh1Q02576 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nhlh1Q02576 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nhlh1Q02576 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nhlh1Q02576 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nhlh1Q02576 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Nhlh1Q02576 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nhlh1Q02576 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nhlh1Q02576 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nhlh1Q02576 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nhlh1Q02576 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nhlh1Q02576 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nhlh1Q02576 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Nhlh1Q02576 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nhlh1Q02576 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nhlh1Q02576 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nhlh1Q02576 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nhlh1Q02576 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nhlh1Q02576 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nhlh1Q02576 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nhlh1Q02576 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nhlh1Q02576 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nhlh1Q02576 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nhlh1Q02576 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nhlh1Q02576 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nhlh1Q02576 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nhlh1Q02576 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nhlh1Q02576 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nhlh1Q02576 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nhlh1Q02576 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nhlh1Q02576 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nhlh1Q02576 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Nhlh1Q02576 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Nhlh1Q02576 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nhlh1Q02576 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nhlh1Q02576 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nhlh1Q02576 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nhlh1Q02576 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nhlh1Q02576 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nhlh1Q02576 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nhlh1Q02576 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nhlh1Q02576 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nhlh1Q02576 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nhlh1Q02576 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nhlh1Q02576 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nhlh1Q02576 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nhlh1Q02576 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nhlh1Q02576 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 287.2 ms