Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Ascl1Q02067 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Ascl1Q02067 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ascl1Q02067 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ascl1Q02067 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ascl1Q02067 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ascl1Q02067 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ascl1Q02067 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ascl1Q02067 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ascl1Q02067 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ascl1Q02067 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ascl1Q02067 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ascl1Q02067 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ascl1Q02067 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ascl1Q02067 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ascl1Q02067 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ascl1Q02067 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ascl1Q02067 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ascl1Q02067 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ascl1Q02067 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ascl1Q02067 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ascl1Q02067 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Ascl1Q02067 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ascl1Q02067 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ascl1Q02067 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ascl1Q02067 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ascl1Q02067 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ascl1Q02067 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ascl1Q02067 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms