Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pde1bQ01065 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pde1bQ01065 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pde1bQ01065 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pde1bQ01065 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pde1bQ01065 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pde1bQ01065 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pde1bQ01065 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pde1bQ01065 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pde1bQ01065 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pde1bQ01065 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pde1bQ01065 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pde1bQ01065 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pde1bQ01065 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pde1bQ01065 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pde1bQ01065 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pde1bQ01065 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pde1bQ01065 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pde1bQ01065 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pde1bQ01065 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pde1bQ01065 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pde1bQ01065 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pde1bQ01065 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pde1bQ01065 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pde1bQ01065 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pde1bQ01065 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pde1bQ01065 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pde1bQ01065 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pde1bQ01065 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pde1bQ01065 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pde1bQ01065 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pde1bQ01065 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pde1bQ01065 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pde1bQ01065 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pde1bQ01065 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pde1bQ01065 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pde1bQ01065 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pde1bQ01065 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pde1bQ01065 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pde1bQ01065 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pde1bQ01065 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pde1bQ01065 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pde1bQ01065 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pde1bQ01065 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pde1bQ01065 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pde1bQ01065 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pde1bQ01065 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pde1bQ01065 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pde1bQ01065 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pde1bQ01065 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pde1bQ01065 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pde1bQ01065 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pde1bQ01065 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Pde1bQ01065 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pde1bQ01065 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pde1bQ01065 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pde1bQ01065 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pde1bQ01065 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pde1bQ01065 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pde1bQ01065 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Pde1bQ01065 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pde1bQ01065 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pde1bQ01065 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pde1bQ01065 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pde1bQ01065 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pde1bQ01065 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pde1bQ01065 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pde1bQ01065 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pde1bQ01065 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pde1bQ01065 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pde1bQ01065 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pde1bQ01065 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pde1bQ01065 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pde1bQ01065 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pde1bQ01065 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pde1bQ01065 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pde1bQ01065 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pde1bQ01065 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pde1bQ01065 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pde1bQ01065 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pde1bQ01065 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pde1bQ01065 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pde1bQ01065 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Pde1bQ01065 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pde1bQ01065 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pde1bQ01065 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde1bQ01065 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde1bQ01065 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde1bQ01065 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pde1bQ01065 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pde1bQ01065 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pde1bQ01065 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pde1bQ01065 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde1bQ01065 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pde1bQ01065 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pde1bQ01065 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde1bQ01065 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde1bQ01065 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde1bQ01065 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde1bQ01065 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 499.2 ms