Protein–RNA interactions for Protein: P98084

Apba2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba2P98084 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Apba2P98084 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Apba2P98084 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Apba2P98084 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Apba2P98084 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Apba2P98084 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Apba2P98084 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Apba2P98084 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Apba2P98084 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Apba2P98084 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Apba2P98084 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Apba2P98084 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Apba2P98084 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Apba2P98084 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Apba2P98084 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Apba2P98084 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Apba2P98084 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Apba2P98084 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Apba2P98084 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Apba2P98084 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Apba2P98084 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Apba2P98084 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Apba2P98084 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Apba2P98084 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Apba2P98084 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Apba2P98084 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Apba2P98084 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Apba2P98084 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Apba2P98084 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Apba2P98084 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Apba2P98084 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Apba2P98084 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Apba2P98084 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Apba2P98084 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Apba2P98084 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Apba2P98084 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Apba2P98084 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Apba2P98084 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Apba2P98084 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Apba2P98084 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Apba2P98084 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Apba2P98084 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Apba2P98084 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Apba2P98084 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Apba2P98084 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Apba2P98084 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Apba2P98084 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Apba2P98084 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Apba2P98084 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Apba2P98084 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Apba2P98084 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Apba2P98084 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Apba2P98084 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Apba2P98084 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Apba2P98084 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Apba2P98084 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Apba2P98084 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Apba2P98084 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Apba2P98084 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Apba2P98084 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Apba2P98084 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Apba2P98084 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Apba2P98084 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Apba2P98084 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Apba2P98084 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Apba2P98084 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Apba2P98084 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Apba2P98084 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Apba2P98084 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Apba2P98084 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Apba2P98084 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Apba2P98084 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Apba2P98084 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Apba2P98084 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Apba2P98084 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Apba2P98084 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Apba2P98084 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Apba2P98084 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Apba2P98084 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Apba2P98084 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Apba2P98084 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Apba2P98084 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Apba2P98084 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Apba2P98084 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Apba2P98084 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Apba2P98084 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Apba2P98084 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Apba2P98084 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Apba2P98084 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Apba2P98084 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Apba2P98084 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Apba2P98084 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Apba2P98084 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Apba2P98084 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Apba2P98084 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Apba2P98084 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Apba2P98084 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Apba2P98084 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Apba2P98084 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Apba2P98084 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.6 ms