Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scn1bP97952 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scn1bP97952 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scn1bP97952 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scn1bP97952 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scn1bP97952 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scn1bP97952 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scn1bP97952 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scn1bP97952 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scn1bP97952 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scn1bP97952 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scn1bP97952 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scn1bP97952 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scn1bP97952 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scn1bP97952 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Scn1bP97952 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Scn1bP97952 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Scn1bP97952 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Scn1bP97952 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Scn1bP97952 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Scn1bP97952 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Scn1bP97952 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Scn1bP97952 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Scn1bP97952 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scn1bP97952 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scn1bP97952 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scn1bP97952 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scn1bP97952 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scn1bP97952 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scn1bP97952 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scn1bP97952 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scn1bP97952 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Scn1bP97952 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Scn1bP97952 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Scn1bP97952 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Scn1bP97952 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Scn1bP97952 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Scn1bP97952 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Scn1bP97952 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Scn1bP97952 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Scn1bP97952 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Scn1bP97952 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Scn1bP97952 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Scn1bP97952 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Scn1bP97952 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Scn1bP97952 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Scn1bP97952 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Scn1bP97952 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scn1bP97952 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scn1bP97952 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scn1bP97952 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scn1bP97952 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scn1bP97952 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scn1bP97952 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scn1bP97952 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scn1bP97952 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scn1bP97952 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scn1bP97952 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scn1bP97952 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scn1bP97952 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scn1bP97952 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scn1bP97952 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scn1bP97952 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scn1bP97952 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Scn1bP97952 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scn1bP97952 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scn1bP97952 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Scn1bP97952 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scn1bP97952 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scn1bP97952 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scn1bP97952 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scn1bP97952 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scn1bP97952 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scn1bP97952 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scn1bP97952 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scn1bP97952 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scn1bP97952 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scn1bP97952 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Scn1bP97952 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Scn1bP97952 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scn1bP97952 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scn1bP97952 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scn1bP97952 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scn1bP97952 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scn1bP97952 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scn1bP97952 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Scn1bP97952 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scn1bP97952 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Scn1bP97952 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Scn1bP97952 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Scn1bP97952 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Scn1bP97952 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Scn1bP97952 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Scn1bP97952 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Scn1bP97952 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Scn1bP97952 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Scn1bP97952 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Scn1bP97952 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Scn1bP97952 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Scn1bP97952 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.7 ms