Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29,48■■■□□ 2,31
Smarcc1P97496 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29,46■■■□□ 2,31
Smarcc1P97496 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,46■■■□□ 2,31
Smarcc1P97496 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Smarcc1P97496 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Smarcc1P97496 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC29,45■■■□□ 2,31
Smarcc1P97496 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Smarcc1P97496 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Smarcc1P97496 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC29,43■■■□□ 2,3
Smarcc1P97496 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Smarcc1P97496 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC29,42■■■□□ 2,3
Smarcc1P97496 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29,41■■■□□ 2,3
Smarcc1P97496 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29,41■■■□□ 2,3
Smarcc1P97496 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29,4■■■□□ 2,3
Smarcc1P97496 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Smarcc1P97496 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Smarcc1P97496 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Smarcc1P97496 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Smarcc1P97496 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC29,39■■■□□ 2,3
Smarcc1P97496 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Smarcc1P97496 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,38■■■□□ 2,29
Smarcc1P97496 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Smarcc1P97496 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Smarcc1P97496 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Smarcc1P97496 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Smarcc1P97496 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Smarcc1P97496 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Smarcc1P97496 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC29,35■■■□□ 2,29
Smarcc1P97496 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29,35■■■□□ 2,29
Smarcc1P97496 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Smarcc1P97496 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Smarcc1P97496 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Smarcc1P97496 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Smarcc1P97496 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Smarcc1P97496 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC29,32■■■□□ 2,28
Smarcc1P97496 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29,32■■■□□ 2,28
Smarcc1P97496 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Smarcc1P97496 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Smarcc1P97496 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Smarcc1P97496 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Smarcc1P97496 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29,28■■■□□ 2,28
Smarcc1P97496 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Smarcc1P97496 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29,26■■■□□ 2,27
Smarcc1P97496 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Smarcc1P97496 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,25■■■□□ 2,27
Smarcc1P97496 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Smarcc1P97496 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,25■■■□□ 2,27
Smarcc1P97496 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Smarcc1P97496 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Smarcc1P97496 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29,23■■■□□ 2,27
Smarcc1P97496 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,23■■■□□ 2,27
Smarcc1P97496 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Smarcc1P97496 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Smarcc1P97496 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC29,22■■■□□ 2,27
Smarcc1P97496 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC29,22■■■□□ 2,27
Smarcc1P97496 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Smarcc1P97496 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,22■■■□□ 2,27
Smarcc1P97496 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29,22■■■□□ 2,27
Smarcc1P97496 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Smarcc1P97496 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Smarcc1P97496 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Smarcc1P97496 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC29,2■■■□□ 2,26
Smarcc1P97496 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,2■■■□□ 2,26
Smarcc1P97496 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Smarcc1P97496 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Smarcc1P97496 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Smarcc1P97496 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Smarcc1P97496 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Smarcc1P97496 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC29,19■■■□□ 2,26
Smarcc1P97496 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Smarcc1P97496 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC29,18■■■□□ 2,26
Smarcc1P97496 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Smarcc1P97496 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29,17■■■□□ 2,26
Smarcc1P97496 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Smarcc1P97496 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Smarcc1P97496 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Smarcc1P97496 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC29,16■■■□□ 2,26
Smarcc1P97496 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Smarcc1P97496 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29,16■■■□□ 2,26
Smarcc1P97496 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Smarcc1P97496 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Smarcc1P97496 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Smarcc1P97496 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Smarcc1P97496 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Smarcc1P97496 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29,14■■■□□ 2,26
Smarcc1P97496 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Smarcc1P97496 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Smarcc1P97496 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29,14■■■□□ 2,26
Smarcc1P97496 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29,14■■■□□ 2,26
Smarcc1P97496 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29,13■■■□□ 2,25
Smarcc1P97496 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Smarcc1P97496 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Smarcc1P97496 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC29,12■■■□□ 2,25
Smarcc1P97496 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC29,12■■■□□ 2,25
Smarcc1P97496 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC29,12■■■□□ 2,25
Smarcc1P97496 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC29,11■■■□□ 2,25
Smarcc1P97496 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29,11■■■□□ 2,25
Smarcc1P97496 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Smarcc1P97496 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Smarcc1P97496 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,4 ms