Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vgll3P85442 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vgll3P85442 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vgll3P85442 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vgll3P85442 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vgll3P85442 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vgll3P85442 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vgll3P85442 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vgll3P85442 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vgll3P85442 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vgll3P85442 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vgll3P85442 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vgll3P85442 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vgll3P85442 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vgll3P85442 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vgll3P85442 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vgll3P85442 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vgll3P85442 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vgll3P85442 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vgll3P85442 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vgll3P85442 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vgll3P85442 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vgll3P85442 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vgll3P85442 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vgll3P85442 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vgll3P85442 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vgll3P85442 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vgll3P85442 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vgll3P85442 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vgll3P85442 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vgll3P85442 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vgll3P85442 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vgll3P85442 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Vgll3P85442 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vgll3P85442 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vgll3P85442 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vgll3P85442 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vgll3P85442 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vgll3P85442 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vgll3P85442 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vgll3P85442 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vgll3P85442 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vgll3P85442 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vgll3P85442 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vgll3P85442 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vgll3P85442 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vgll3P85442 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vgll3P85442 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vgll3P85442 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vgll3P85442 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Vgll3P85442 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vgll3P85442 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vgll3P85442 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vgll3P85442 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vgll3P85442 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vgll3P85442 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vgll3P85442 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vgll3P85442 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vgll3P85442 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vgll3P85442 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Vgll3P85442 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vgll3P85442 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vgll3P85442 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vgll3P85442 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vgll3P85442 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vgll3P85442 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vgll3P85442 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Vgll3P85442 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vgll3P85442 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vgll3P85442 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vgll3P85442 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vgll3P85442 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vgll3P85442 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vgll3P85442 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Vgll3P85442 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vgll3P85442 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vgll3P85442 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vgll3P85442 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vgll3P85442 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Vgll3P85442 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vgll3P85442 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vgll3P85442 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vgll3P85442 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vgll3P85442 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vgll3P85442 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vgll3P85442 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vgll3P85442 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vgll3P85442 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vgll3P85442 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vgll3P85442 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Vgll3P85442 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vgll3P85442 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vgll3P85442 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vgll3P85442 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vgll3P85442 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vgll3P85442 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vgll3P85442 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vgll3P85442 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vgll3P85442 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vgll3P85442 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms