Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tubg1P83887 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tubg1P83887 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tubg1P83887 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tubg1P83887 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tubg1P83887 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tubg1P83887 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tubg1P83887 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tubg1P83887 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tubg1P83887 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tubg1P83887 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tubg1P83887 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tubg1P83887 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tubg1P83887 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tubg1P83887 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tubg1P83887 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tubg1P83887 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tubg1P83887 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Tubg1P83887 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tubg1P83887 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tubg1P83887 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tubg1P83887 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tubg1P83887 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tubg1P83887 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tubg1P83887 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tubg1P83887 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tubg1P83887 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tubg1P83887 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tubg1P83887 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Tubg1P83887 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Tubg1P83887 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tubg1P83887 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tubg1P83887 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tubg1P83887 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Tubg1P83887 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tubg1P83887 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tubg1P83887 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tubg1P83887 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tubg1P83887 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tubg1P83887 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Tubg1P83887 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tubg1P83887 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tubg1P83887 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tubg1P83887 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tubg1P83887 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tubg1P83887 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tubg1P83887 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tubg1P83887 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tubg1P83887 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tubg1P83887 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tubg1P83887 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tubg1P83887 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Tubg1P83887 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tubg1P83887 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tubg1P83887 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tubg1P83887 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tubg1P83887 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tubg1P83887 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tubg1P83887 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tubg1P83887 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tubg1P83887 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tubg1P83887 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Tubg1P83887 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tubg1P83887 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tubg1P83887 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tubg1P83887 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tubg1P83887 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tubg1P83887 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tubg1P83887 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Tubg1P83887 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tubg1P83887 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tubg1P83887 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tubg1P83887 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tubg1P83887 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Tubg1P83887 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tubg1P83887 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tubg1P83887 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Tubg1P83887 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tubg1P83887 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Tubg1P83887 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Tubg1P83887 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Tubg1P83887 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Tubg1P83887 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tubg1P83887 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tubg1P83887 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tubg1P83887 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tubg1P83887 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tubg1P83887 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tubg1P83887 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tubg1P83887 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tubg1P83887 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tubg1P83887 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tubg1P83887 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tubg1P83887 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tubg1P83887 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tubg1P83887 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tubg1P83887 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tubg1P83887 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tubg1P83887 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tubg1P83887 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms