Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Nucb2P81117 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25,5■■□□□ 1,67
Nucb2P81117 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Nucb2P81117 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Nucb2P81117 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Nucb2P81117 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25,49■■□□□ 1,67
Nucb2P81117 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Nucb2P81117 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Nucb2P81117 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Nucb2P81117 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Nucb2P81117 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Nucb2P81117 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Nucb2P81117 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Nucb2P81117 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Nucb2P81117 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Nucb2P81117 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Nucb2P81117 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Nucb2P81117 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,67
Nucb2P81117 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Nucb2P81117 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,45■■□□□ 1,66
Nucb2P81117 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Nucb2P81117 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,66
Nucb2P81117 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Nucb2P81117 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Nucb2P81117 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Nucb2P81117 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Nucb2P81117 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Nucb2P81117 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Nucb2P81117 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Nucb2P81117 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Nucb2P81117 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Nucb2P81117 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Nucb2P81117 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Nucb2P81117 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Nucb2P81117 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Nucb2P81117 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Nucb2P81117 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Nucb2P81117 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Nucb2P81117 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Nucb2P81117 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Nucb2P81117 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Nucb2P81117 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Nucb2P81117 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Nucb2P81117 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Nucb2P81117 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Nucb2P81117 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Nucb2P81117 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Nucb2P81117 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Nucb2P81117 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25,39■■□□□ 1,65
Nucb2P81117 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Nucb2P81117 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25,38■■□□□ 1,65
Nucb2P81117 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25,38■■□□□ 1,65
Nucb2P81117 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25,38■■□□□ 1,65
Nucb2P81117 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Nucb2P81117 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Nucb2P81117 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Nucb2P81117 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25,37■■□□□ 1,65
Nucb2P81117 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Nucb2P81117 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Nucb2P81117 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Nucb2P81117 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Nucb2P81117 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Nucb2P81117 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Nucb2P81117 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Nucb2P81117 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Nucb2P81117 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Nucb2P81117 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Nucb2P81117 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Nucb2P81117 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Nucb2P81117 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Nucb2P81117 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Nucb2P81117 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Nucb2P81117 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Nucb2P81117 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Nucb2P81117 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Nucb2P81117 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Nucb2P81117 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Nucb2P81117 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Nucb2P81117 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,33■■□□□ 1,65
Nucb2P81117 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Nucb2P81117 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,64
Nucb2P81117 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,64
Nucb2P81117 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Nucb2P81117 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Nucb2P81117 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Nucb2P81117 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Nucb2P81117 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Nucb2P81117 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Nucb2P81117 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Nucb2P81117 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Nucb2P81117 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Nucb2P81117 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Nucb2P81117 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Nucb2P81117 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25,29■■□□□ 1,64
Nucb2P81117 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25,29■■□□□ 1,64
Nucb2P81117 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25,29■■□□□ 1,64
Nucb2P81117 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Nucb2P81117 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25,29■■□□□ 1,64
Nucb2P81117 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Nucb2P81117 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,5 ms